ChIA-PET2报错合集

最新推荐文章于 2024-04-22 15:33:16 发布

很酷的女超人

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分类专栏： ChIA-PET2

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/viola_/article/details/118958107

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这篇博客详细记录了ChIA-PET2分析过程中遇到的macs2、QCplots和第七步的报错及解决方法。对于macs2，问题在于不在特定conda环境中运行，切换环境并使用python3.8和macs2 2.2.5版本解决了问题。Running Step 6: QCplots报错通过修改得到解决。在第七步中，首先遇到的问题是数据量太少，通过增加数据量并调整参数使得micc可以运行成功，但可能会影响精度，计划后续进行大规模数据测试以确定是否需要进一步调整参数。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

一、关于macs2报错：

1、报错

在这里插入图片描述

解决

原因：没在sun conda环境下跑
切到sun环境下就好了

2、报错

在网上找到了一样的报错

Traceback (most recent call last):
  File "/home/server/shm/conda/condaa/envs/sun/bin/macs2", line 653, in <module>
    main()
  File "/home/server/shm/conda/condaa/envs/sun/bin/macs2", line 49, in main
    from MACS2.callpeak_cmd import run
  File "/home/server/shm/conda/condaa/envs/sun/lib/python3.8/site-packages/MACS2/callpeak_cmd.py", line 23, in <module>
    from MACS2.OptValidator import opt_validate
  File "/home/server/shm/conda/condaa/envs/sun/lib/python3.8/site-packages/MACS2/OptValidator.py", line 20, in <module>
    from MACS2.IO.Parser import BEDParser, ELANDResultParser, ELANDMultiPar

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