基于图神经网络的药物-靶点相互作用预测
1.1 书籍背景
随着生物信息学和药物研发的快速发展,药物-靶点相互作用预测(Drug-Target Interaction Prediction)已成为药物设计领域的关键任务之一。然而,传统的药物-靶点相互作用预测方法通常基于统计学模型或机器学习算法,存在准确性不足、可解释性差等问题。近年来,图神经网络(Graph Neural Networks,GNN)作为一种新兴的深度学习技术,在处理图结构数据方面展现出强大的能力,为药物-靶点相互作用预测提供了新的思路。
本书旨在介绍基于图神经网络的药物-靶点相互作用预测方法,系统性地讲解图神经网络的基础知识、药物-靶点相互作用数据预处理、图神经网络模型设计与应用,以及实际案例分析和挑战与展望。通过本书的学习,读者可以深入了解图神经网络在药物-靶点相互作用预测领域的应用,并掌握相关技术实现方法。
本书分为七个章节:
- 第1章 引言:介绍书籍背景、药物-靶点相互作用预测的重要性以及图神经网络的基本概念。
- 第2章 图神经网络基础:讲解图神经网络的相关知识,包括图论基础、神经网络基础以及图神经网络的工作原理。
- 第3章 药物-靶点相互作用数据预处理:介绍药物-靶点相互作用数据来源、数据清洗和数据集成方法。
- 第4章 图神经网络在药物-靶点相互作用预测中的应用:详细讲解药物-靶点相互作用的图表示、图神经网络模型设计以及模型训练与优化。