生物&统计学词汇解释

最新推荐文章于 2024-09-07 19:40:10 发布

Mesysky

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分类专栏：统计学文章标签：统计学生物

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在处理TCGA数据的时候遇到了处理后的基因表达数据，log2 lowess normalized (cy5/cy3) collapsed by gene symbol

cy5和cy3是两种蛋白质染料的名字，用于2D胶分离。（生物实验知识，了解就好）

计算Ratio 值(= Cy3/Cy5)。在0.5-2.0 之外的定义为在两样本中有明显差异表达。进而获取初步功能信息。

log2 lowess normalized (cy5/cy3)是一种标准化的方法。局部加权回归散点平滑法(locally weighted scatter plot smoothing)，LOWESS，是查看二维变量之间的关系(平滑x-y曲线)的一种有力工具。