通用:
VTK
VTK (the visualization toolkit)是一款免费开源的用于三维计算机图形学、图像处理以及可视化的软件包。包含了C++类库并且提供对Tcl/Tk, Java 和Python等解释性语言的支持.
ITK
ITK是一个开源、跨平台的,提供了大量的图像处理功能的软件工具。可用于多维图像的分割与配准。
FSL
FSL是一个用于分析fMRI,MRI和DTI大脑成像数据的综合软件库。
SPM
SPM(statistical parametric mapping) 指的是建立和评估统计处理方法,用于对功能影像数据的假设检验。SPM软件包已用于分析大脑图像序列。这些序列可以是来自不同群体的数据,或者是同一个个体的不同时间序列的数据。目前可用于分析fMRI, PET, SPECT,EEG和MEG。
GIMIAS
GIMIAS是一个面向工作流的图像处理环境,用于解决高级图像计算以及个体化的模拟问题。可通过添加解决特定问题的插件而进行扩展。此外,GIMIAS提供开源框架,可有效开发研究和临床软件原型,也可用于商业软件开发。提供的功能包括手动和自动分割,可视化,网格编辑和电子机械及流体力学模拟等。
3D Slicer
3D Slicer是一个免费、开源软件包,用于可视化及图像分析。可在多个平台上使用,包括Windows, Linux 和Mac Os X。
MIA
MIA是一个用C++写的通用图像处理工