6、氨基酸与多肽几何结构的深入剖析

氨基酸与多肽几何结构的深入剖析

1. CA - CA 键偏差分析

首先，我们排除了六个文件后，得到 CA - CA 键的最大偏差至多为 30%。图展示了不同最大偏差下文件数量的分布情况，横坐标每一格代表 1%的最大偏差。对应的值如下：
|最大偏差（%）|文件数量|
| ---- | ---- |
|1|1260|
|2|920|
|3|282|
|4|70|
|5|20|
|6|13|
|7|4|
|8|2|
|9|1|
|10|0|
|11|0|
|12|0|
|13|2|
|14|3|
|15|3|
|16|1|
|17|2|
|18|5|
|19|3|
|20|8|
|21|12|
|22|24|
|23|30|
|24|28|
|25|33|
|26|49|
|27|48|
|28|12|
|29|1|
|30|0|

有趣的是，大多数文件的偏差小于 5 - 6%，但还有一个聚集值为 25%。我们推测肽键 C - N 的较大偏差可能是这种“聚集”现象的一个明显原因。

2. 肽键长度偏差估计

我们对连续氨基酸之间肽键 C - N 的偏差进行了研究，发现这些偏差小于 7.8%。图展示了不同最大偏差下多肽数量的分布，横坐标步长为 0.2%。由此可知，CA - CA 距离分布的聚集现象并非由肽键引起。

3. 鲍林平面定律验