【非Root用户ubuntu 20.04安装GPU加速版gromacs 2022.5】

非Root用户Ubuntu 20.04安装GPU加速GROMACS 2022.5指南

原创

已于 2023-08-04 15:47:52 修改 · 884 阅读

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#数学建模 #机器学习

于 2023-07-16 15:28:44 首次发布

本文详细介绍了非Root用户在Ubuntu 20.04上安装CUDA、cmake、fftw，并通过GPU加速安装GROMACS 2022.5的步骤。首先，检查和配置CUDA环境，然后检查和安装cmake 3.+版本，接着安装fftw，并在最后安装GROMACS，设置相应的环境变量确保软件正确运行。

非Root用户ubuntu 20.04安装GPU加速版gromacs 2022.5

1.安装cuda
2.安装cmake
- 1.1检查系统是否自带cmake
- 1.2若无3.+版本，则需安装
2.安装fftw
3.安装GROMACS

1.安装cuda

输入nvidia-smi命令查看支持的cuda版本在这里插入图片描述可以自己安装或请管理员帮忙安装，我这里使用管理员安装好的cuda，需使用vi ~/.bashrc命令在环境变量中添加如下两行命令：
export PATH=/usr/local/cuda-11.7/bin $KaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: {PATH:+:$ {PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.7/lib64 $KaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: \dotsLIBRARY_PATH:+:$ {LD_LIBRARY_PATH}}
保存后退出，运行source ~/.bashrc命令使修改生效。
使用nvcc -V命令可查看到cuda版本信息
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