【非Root用户ubuntu 20.04安装GPU加速版gromacs 2022.5】

本文详细介绍了非Root用户在Ubuntu 20.04上安装CUDA、cmake、fftw,并通过GPU加速安装GROMACS 2022.5的步骤。首先,检查和配置CUDA环境,然后检查和安装cmake 3.+版本,接着安装fftw,并在最后安装GROMACS,设置相应的环境变量确保软件正确运行。

1.安装cuda

输入nvidia-smi命令查看支持的cuda版本在这里插入图片描述可以自己安装或请管理员帮忙安装,我这里使用管理员安装好的cuda,需使用vi ~/.bashrc命令在环境变量中添加如下两行命令:
export PATH=/usr/local/cuda-11.7/binKaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: {PATH:+:{PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.7/lib64KaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: …LIBRARY_PATH:+:{LD_LIBRARY_PATH}}
保存后退出,运行source ~/.bashrc命令使修改生效。
使用nvcc -V命令可查看到cuda版本信息
![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/b35be600b8e44193a8e8c692779f6d7c.png

2.安装cmake

1.1检查系统是否自带cmake

cmake -version
在这里插入图片描述

1.2若无3.+版本,则需安装

<
### 如何在Ubuntu 20.04安装Vivado 2022.2 #### 准备工作 为了确保顺利安装,建议先更新系统软件包列表并升级现有软件包: ```bash sudo apt update && sudo apt upgrade -y ``` 接着,按照官方推荐,需安装一些依赖库来支持 Vivado 的运行环境。对于 Ubuntu 20.04 本来说,特别需要注意的是 `libncurses5` 这个库[^1]。 #### 下载与准备工具 创建一个新的文件夹用于存放即将下载的安装文件,并赋予适当权限以便后续操作。通常情况下,这个目录会被命名为 tools 或者其他容易识别的名字。 ```bash mkdir ~/tools cd ~/tools chmod a+x *.bin # 假设已经下载好了自解压web安装器到此路径下 ``` #### 执行安装过程 启动赛灵思统一安装程序 (Xilinx Unified Installer),这可以通过命令行执行之前获得可执行权限的那个 .bin 文件完成。根据提示逐步选择要安装的产品本(这里应选 Vivado HLx 2022.2),指定目标位置以及其他必要配置项[^2]。 #### 配置环境变量 成功安装之后,还需要设置好相应的环境变量才能正常使用新装好的开发套件。可以编辑用户的 shell profile 文件(比如 `.bashrc` 或者 `.zshrc`)加入如下内容: ```bash source /opt/Xilinx/Vivado/2022.2/settings64.sh ``` 记得使这些更改生效: ```bash source ~/.bashrc # 如果使用的是 bash 终端的话 ``` 通过以上步骤,在 Ubuntu 20.04 上就可以顺利完成 Vivado 2022.2 的安装了[^3]。
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