血管增强的各向异性扩散滤波(VED算法)

本文探讨了血管增强算法,特别是基于各向异性扩散的Frangi滤波器及其在噪声敏感性方面的局限性。Rashindra Manniesing的Vessel Enhancing Diffusion(VED)算法对此进行了改进,通过平滑因子和扩散张量来减少噪声影响并增强血管区域。在实施过程中,计算扩散张量的一阶梯度是关键步骤,涉及中心差分法。尽管经过一次迭代后图像平滑度提高,但部分细小血管可能被平滑,这与论文结果存在差异,暗示对算法理解可能存在误差,需要进一步测试和调整。

这一段时间一直在做关于血管增强的算法,查阅了一些论文,发现现在比较常用的就是基于各向异性扩散的血管增强算法,而这种增强算法主要使用的就是图像Hessian矩阵的特征值和特征向量。比较经典的增强算法是Frangi在1998年发表的Multiscale vessel enhancement filter, 该算法中主要通过Hessian矩阵的特征值和特征向量构建了所谓的血管参数(这里不罗列公式,可以googleFrangi的论文),通过统计对于每一个像素点的血管参数几乎都是0-1之间的数(用来表征图像中像素点属于血管的概率值---这里是本人的理解,如果有错误请指出),所以通过血管参数就可以通过归一化这个数据,然后再映射到0-4096区间内,得出血管的位置。但是这个算法有一个缺点就是对噪声比较敏感,所以在增强之后会出现许多假的“血管”,也就是其他的脑组织,但是对细小血管的分割效果还是不错的。基于这个缺陷,Rashindra Manniesing在其06年发表的一片论文中(Vessel Enhancing diffusion)对该算法进行了改进,其改进的方向主要是两点:首先在血管函数中增加了平滑因子,使得该函数可以降低对噪声的影像,达到平滑的目的,另外,通过构建扩散张量,使用扩散方程对图像进行扩散滤波,以达到对血管的区域进行增强,而对背景区域进行抑制处理。基本的思想也就是这些了,这里我主要分享以下在实现过程中遇到的问题:在计算出每一点的扩散张量后,由于所处理的数据为3维体数据,所以每一点的扩散张量实际上是一个3*3的矩阵(这里不同于传统PM方程中扩散函数),然后再计算扩散方程的过程中,需要分别计算图像的一阶梯度图像,二阶梯度图像以及扩散张量的一阶梯度。这里扩散张量的一阶梯度主要是通过计算相邻像素(6个方向)的扩散张量的对应位置的值计算出来的。例如,计算扩散张量第一行的三个值,这三个值表示了扩散张量在x方向上的梯度,所以首先要计算出该像素点左侧像素点的扩散张量以及该像素点右侧像素点的扩散张量,然后通过中心差分法计算出当前像素点所对应的扩散张量第一行的三个值:如果B点为当前点,A点和C点位左右两个相邻的像素值(x方向),对应的tensorA(0,0)=(tensorC(0,0)-tensorA(0,0))/2。同理可得其他像素点的扩散张量在三个方向上的一阶导数。

### VED算法在Matlab中的实现 VED(Variational Encoding Decoding)算法是一种基于变分自编码器框架的方法,在处理序列数据方面具有广泛应用。下面提供一段简单的VED算法的Matlab实现示例代码及其解释。 #### 1. 初始化参数设置 ```matlab % 设置超参数 latent_dim = 2; % 隐含层维度大小 batch_size = 64; epochs = 50; % 数据预处理部分省略... ``` 这段代码初始化了一些必要的变量,比如隐含空间(`latent_dim`)的尺寸等基本配置项[^1]。 #### 2. 构建模型结构 ```matlab % 定义编码器网络架构 encoder_inputs = inputLayer([input_shape], 'Name', 'EncoderInput'); x = lstmLayer(hidden_units, 'OutputMode', 'sequence', 'Name', 'LSTM_Encoder'); z_mean_layer = fullyConnectedLayer(latent_dim, 'Name', 'ZMean'); z_log_var_layer = fullyConnectedLayer(latent_dim, 'Name', 'ZLogVar'); % ... 中间层定义 ... % 定义解码器网络架构 decoder_input = inputLayer([latent_dim], 'Name', 'DecoderInput'); repeat_vector = repeatVector(max_length, 'Name', 'RepeatVector'); y = lstmLayer(hidden_units, 'OutputMode', 'sequence', 'Name', 'LSTM_Decoder'); output_layer = fullyConnectedLayer(vocab_size, 'Name', 'OutputLayer'); % 组合形成完整的VED模型 ved_model = assembleNetwork(encoder_layers, decoder_layers); ``` 此段展示了如何构建编码器和解码器两大部分,并通过`assembleNetwork()`函数组合起来创建整个VED体系结构。 #### 3. 训练过程 ```matlab for epoch = 1:epochs for i = 1:num_batches % 获取批次样本 batch_data = getBatchData(i); % 前向传播计算损失值 [~, loss_value] = forward(ved_model, batch_data); % 反向传播更新权重 updateWeights(ved_model, gradients); disp(['Epoch ', num2str(epoch), '/', num2str(epochs)]); disp(['Loss:', num2str(loss_value)]); end end ``` 上述循环实现了对模型的一轮或多轮次迭代训练操作,其中包括获取每批训练集、执行前馈预测以及利用反向传播调整权值的过程。 请注意这只是一个简化版的例子,实际应用中还需要考虑更多细节如优化器的选择、正则化技术的应用等问题。
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