学习笔记
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riri04721
这个作者很懒,什么都没留下…
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EMO包学习笔记3——1.1.pipeline.metm.R
丰度分级:将微生物按相对丰度分为高、中、低三个等级代表性选择:从每个等级中选择指定数量的代表性微生物可视化:创建堆叠柱状图展示这些代表性微生物的组成图形组合:将不同丰度等级的图形拼接在一起这个数据预处理:选择前15个最丰富的分类单元样本聚类:使用Bray-Curtis距离和完全连接法对样本进行层次聚类聚类切割:将样本分为3个主要簇环形可视化:创建环形布局的堆积柱状图外环:显示样本的微生物组成内环:显示聚类结果和样本分组# 指定丰度高中低丰度 范围展示环状物种#--------Top = 20,原创 2025-09-18 14:47:35 · 793 阅读 · 0 评论 -
EMO包学习笔记2
📊 **microbiome 包**:专门为微生物组数据分析设计的包,提供了一系列处理16S rRNA和宏基因组数据的工具。writeData(beta_wb, "adonis_results", dat1) # 将数据写入该工作表。:Group(主要处理),Group2(时间点),Group3(批次):排序图形状显著相似(R=0.691, p=0.030):群落结构不相似(R=0.195, p=0.159):群落结构不相似(R=0.134, p=0.187)原创 2025-09-17 20:39:32 · 800 阅读 · 0 评论 -
EasyMultiOmics包学习笔记1
为什么这个操作很重要?在数据分析和可视化的代码中,使用这种。原创 2025-09-10 16:58:34 · 711 阅读 · 0 评论
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