GEO数据如何查看样本信息|GEO数据区分疾病和正常样本

GEO数据如何查看样本信息|GEO数据区分疾病和正常样本

#导入相关包
library(GEOquery)

#设置GSE，替换成自己的GSE即可
gse_id <- "GSE8671"

# 使用getGEO函数获取数据集的基础信息
gse_info <- getGEO(gse_id, destdir = ".", AnnotGPL = FALSE ,getGPL = F)

#提取临床信息 方法一：$或者@ ，配合str()观察结构
pdata = gse_info$GSE8671_series_matrix.txt.gz@phenoData@data
View(pdata)

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