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Illumina测序包裹文库制备、簇生成、测序、数据分析四个过程。注：泳道1和3（泳道对A）同时成像。泳道2和4（泳道对B）再泳道对A完成后成像。注：相机编号为1-6。相机1-3对泳道1成像。相机4-6对泳道3成像。对泳道1和3成像后，成像模块会沿x轴方向移动，以便对泳道2和4成像。BCL文件是由Illumina测序仪生成的测序文件，包含测序的信息。包括簇数和碱基信息。注：整数在内存中表示时从高地址向低地址表示。18 18 AA 08（16进制）实际表示为08 AA 18 18，即需要倒序为真实整数。注：b

序列比对是生物信息学中非常重要的一个概念，对分析生物数据具有不可或缺的作用。目前绝大多数的序列比对工具均包含了基于动态规划的序列比对的步骤。序列比对问题类似于最长公共子序列问题 （Longest Common Subsequence problem, LCS) ，进而衍生出了全局比对算法尼德曼-翁施算法 （Needleman-Wunsch Algorithm） 与局部比对算法史密斯-沃特曼算法 （Smith-Waterman algorithm） 。.........