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原创 limma包差异分析
limma 最初是针对基因芯片数据开发的,但后来也被应用于 RNA 测序数据。limma 基于线性模型,使用加权最小二乘法来估计基因表达的差异,并通过贝叶斯方法来校正多重检验问题。limma 通常假设基因表达数据服从正态分布,在处理大规模数据时表现出色,适用于高通量数据分析,如芯片和大规模RNA测序数据,能够很好地控制假阳性率。limma也是广义线性模型的一种,其对每个gene的表达量拟合一个线性方程。limma的分析过程包括ANOVA分析、线性回归等。
2023-10-09 11:30:54
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原创 使用Python生成可执行的.exe文件
PyInstaller其实就是把python解析器和脚本打包成一个可执行的文件,和编译成真正的机器码完全是两回事,所以不要指望成打包成一个可执行文件会提高运行效率,相反可能会降低运行效率。好处就是在运行者不用安装python和脚本依赖库。在Linux操作系统下,它主要用的binutil工具包里面的ldd和objdump命令。需要注意的是,PyInstaller打包的执行文件,只能在和打包机器系统同样的环境下。也就是说,不具备可移植性。
2023-04-16 21:37:26
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原创 安装R包报错 [tcl] grab failed: window not viewable.的解决方案
安装R包报错 [tcl] grab failed: window not viewable.的解决方案
2023-04-03 17:47:41
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原创 DataFrame.nlargest(n, columns, keep=‘first‘)
DataFrame.nlargest(n, columns, keep=‘first’)
2023-01-10 23:04:51
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