python加simpleITK读取CT图像遇到的问题

最新推荐文章于 2024-05-09 22:43:42 发布
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分类专栏： simpleITK 文章标签： python
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/qq_40433890/article/details/109215750
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在使用Python的SimpleITK库处理CT序列文件时，遇到执行错误，尽管路径中不含中文，但问题可能与路径格式有关。博主求助于解决路径解析问题，寻求解决思路。

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在python加simpleITK读取CT序列文件时出现问题
代码为：ct_path = r"D:\路径\ct" dicom_reader = sitk.ImageSeriesReader() dicom_file_names =dicom_reader.GetGDCMSeriesFileNames(ct_path) if not dicom_file_names: pass dicom_reader.SetFileNames(dicom_file_names) dicom_image = dicom_reader.Execute()
出现错误：Exception thrown in SimpleITK ImageSeriesReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageSeriesReader.cxx:129: sitk::ERROR: File names information is empty. Cannot read series. File "D:\路径\.py", line 39, in <module> dicom_image = dicom_reader.Execute()
参考

https://blog.youkuaiyun.com/weixin_40262703/article/details/79995792

说是路径中存在中文的原因 但是我的路径中没有中文呀 ，求大神帮忙解决

（7）图像配准工具：ITK + SimpleITK + SimpleElastix + Elastix + ITKElastix + PyElastix + ANTsPy
shinuone的博客
02-04 2458
常见的图像配准工具包括SimpleITK、SimpleElastix、Elastix、ITKElastix和PyElastix。这些工具提供了强大的图像配准功能，支持医学、生物学等领域的图像处理和分析，为研究和临床应用提供了重要支持。
影像组学 SimpleITK: reader.Execute() cxx: 102 报错解决
m0_51796621的博客
05-08 2547
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageSeriesReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:102: sitk::ERROR: Unable to open "E:\我的笔记\影像组学笔记\renal_carcinoma\renal_carcinoma\reca_desensitization\SRS00010\IMG00000.DCM" for reading.
SimpleITK读取mhd文件报错Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK-build/
weixin_43539289的博客
03-18 4502
在python中用SimpleITK读取mhd文件报错 Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK-build/ No such file or directory. 原因是读取mhd文件时文件夹中必须同时要有对应的raw文件，我在处理文件的时候把raw文件删除了，所以出现报错。把raw文件恢复之后不再报错。 ...
【数据处理】Python读取.dcm文件的方法(解决报错:Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: D:\a\1\sitk\Cod)
风巽·剑染春水的博客
01-10 5499
一、SimpleITK读取 import SimpleITK import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt image = SimpleITK.ReadImage(r"G:5511-2-00001.dcm") image = np.squeeze(SimpleITK.GetArrayFromImage(image)) plt.imshow(image) plt.show() SimpleITK有个缺点是：dcm文件的路径中不能含有中文，否则会报
site:blog.csdn.net Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: D:\a\1\sitk\Code\IO\src\si
weixin_64088375的博客
05-09 349
SimpleITK错误，sitk.ReadImage未设置路径。
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileWriter_Execute
m0_72133175的博客
10-11 726
先检查路径里面有没有包含中文，有的话改为English.Damn(重音).
如何使用Python的SimpleITK库读取CT图像，并提取其切片厚度、像素间距以及图像原点信息？
最新发布
11-07
在医疗图像分析中，正确读取CT图像并获取其元数据是至关重要的。为了深入理解SimpleITK在这一过程中的应用，推荐参考《博雅大数据-肺癌影像诊断CT图像处理代码详解》这一资料。这本书详细介绍了如何利用SimpleITK...
对python读取CT医学图像的实例详解
09-19
接下来，我们开始读取CT图像文件。这里假设CT图像文件是Meta Header Data (MHD) 格式，如示例中的`filename`变量所示： ```python filename = "F:/cancer_solution/data/train_subset00/LKDS-00058.mhd" ds = sitk....
python读取dicom序列_python读取dicom图像（SimpleITK和dicom包实现）
weixin_31992501的博客
02-21 1346
1. 用SimpleITK读取dicom序列：import SimpleITK as sitkimport numpy as npimg_path='F:\\dataset\\pancreas\\Output\\thick\\original\\1'mask_path='F:\\dataset\\pancreas\\Output\\thick\\groundtruth\\1'reader = si...
使用SimpleITK读取和保存NIfTI/DICOM文件实例
09-16
在IT领域，尤其是在医学影像...总的来说，SimpleITK和ITK为医学图像处理提供了强大的功能，包括读取、保存、转换以及复杂的图像分析和处理任务。理解如何有效地使用这些工具对于在医疗影像领域进行研究和开发至关重要。
缺陷检测-如何用深度学习进行CT影像肺结节探测（附有基于Intel Extended Caffe的3D Faster RCNN代码开源）
JIN JI 2013.12.24
01-11 9248
近期宜远智能参加阿里天池医疗AI大赛，用3D Faster RCNN模型在CT影像的肺结节探测上，取得了较好的成绩，特别是在计算资源充足的情况下，模型效果表现优异。这是他们的经验分享（https://tianchi.aliyun.com/competition/new_articleDetail.html?raceId=231601&postsId=2898&from=part ），末尾还附有代码
已解决RuntimeError: Exception throm in SimplelTk
努力让自己发光，对的人才能迎着光而来
04-10 8595
已解决return _SimpleITK.ImageFileReader_Execute(self) RuntimeError: Exception throm in SimplelTk ImageFileReader_Execute:D:la1sitk\CodeI0srcsitkImageReaderBase.cxx:105: sitk::ERROR: Unable to determine ImagelD reader for "D:zuj\fx05(IOSUDA-master datasetsreti
【Debug记录】Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute|路径不存在|../../..\ is not exist
m0_51141265的博客
03-12 6434
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute: /tmp/SimpleITK/Code/IO/src/sitkImageReaderBase.cxx:97:sitk::ERROR: The file "./dataset/data_fix\ct_0001.nii.gz" does not exist.
解决异常SimpleITK: reader.Execute() cxx: 102
qq_51307719的博客
03-04 1275
解决Exception thrown in SimpleITK ImageFileReader_Execute：D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.D:\a\1\sitk\Code\IO\src\sitkImageReaderBase.cxx:102:问题。1.不要使用中文路径，我的出错原因是使用了中文路径，修改为英文路径后就解决问题了。2.不要用“/” ，把引用路径名全部改成"\\"，这是另外一个博主出现异常的原因。
SimpleITK.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(path)中path不能含中文
weixin_40262703的博客
04-18 7744
否则会报以下错：SimpleITK没有ImageSeriesReader函数；AttributeError: module 'SimpleITK' has no attribute 'ImageSeriesReader' 2. 由于ImageSeriesReader()问题导致读入数据为空。RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ImageS...
已解决return _SimpleITK.ImageFileReader_Execute(self)
努力让自己发光，对的人才能迎着光而来
04-10 9799
已解决return _SimpleITK.ImageFileReader_Execute(self) RuntimeError: Exception throm in SimplelTk ImageFileReader_Execute:D:la1sitk\CodeI0srcsitkImageReaderBase.cxx:105: sitk::ERROR: Unable to determine ImagelD reader for "D:zuj\fx05(IOSUDA-master datasetsreti
【Python】Labelme/PIL读取图片朝向错误解决
SpriteNym的博客
12-01 2113
记得事先确认图片质量呀
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