知识积累:
期刊TMI:IEEE Transactions on Medical Imaging MIA:Medical Image Analysis
会议MICCAI:International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention9-10月
IPMI:Information Processing inMedical Imaging (两年一篇)
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging(每年4月)
SPIE Medical Imaging(每年2月)
网站:grand-challenge.org
采用的方法3D Unet + Residual Block(V-net)
经典网络UNet、Vnet
关键步骤在于图像的预处理:
1、图像重采样
2、灰度值的cut off,考虑器官的窗宽窗位,Z-score是常见的灰度值标准化方法,能避免网络权重初始化的时候产生明显的bias(所有样本能归到分类面的同一侧
比赛分割可参考的论文:http://results.kits-challenge.org/miccai2019/manuscripts/Isensee_1.pdf
2019年肝肿瘤分割的最高标准https://arxiv.org/pdf/1901.04056v1.pdf
未来发展,医学图像分割在医疗AI领域的发展,基于深度学习的方法相比与传统的主动形状模型,水平集、图割等方法有i很大的优势
工具:
配准:SimpleElastix
数据集: sfikas/medical-imaging-datasets
ITK-SNAP
3D Slicer
实际意义上的分割,无论是对肝脏还是肿瘤,最重要的是解决问题,解决问题的前提 脚踏实地扎实基础