如何在win10，R studio上安装MuxViz

首先安装R环境+R studio（记住R的路径）

注：我使用的R 的版本是3.6.2，以及欢迎大家讨论安装的问题，我前前后后安装好几天，也查不到什么资料，大概是没有什么人做我这个方向吧。muxViz提供的另一个平台，GNU Octave我也试过，不过比R更劝退，我寻思了一下，还是在R上安装吧。

如何查看R的版本：在控制台输入version就可以。

 

本文从这里开始

1、在https://github.com/manlius/muxViz中下载Muxviz的库

2、将下载好的文件放在R目录里（或者随便找个位置），解压

3、打开R studio，如果后面的过程中出现permission denied的问题，建议这里以管理员的身份打开这个软件。

4、在控制台中将R studio的工作路径切换到刚刚解压的muxViz文件夹中，这里是我的解压路径。

setwd('D:/soft/other/R/muxviz/muxViz-master')

如果还出现permission denied的情况，那可能是因为没有切换工作目录。

5、在安装muxViz之前有几个包要预先安装：

install.packages("sp")
install.packages("rgdal")

• 在安装rgdal的时候可能会出现一些问题，参照http://stackoverflow.com/questions/15248815/rgdal-package-installation
• 我在这里没有测试其他版本的rgdal可不可以，如果后续出现问题，可以尝试将rgdal降级到1.3.2版本。（如果有尝试最新版本成功的同学可以在下面留言，就不用尝试降级了）

降级方式：

1.查看包的名字和版本
installed.packages()[,c('Package','Version','LibPath')]

2.移除包
remove.packages('xxx')

3.下载我尝试过能够成功的版本
packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rgdal/rgdal_1.3-2.tar.gz"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

6、双击这个R文件，这个文件会在R studio中被打开，

全选，运行该文件（这一次是在检查muxViz运行前，所有的包是否都安装成功）

7、如果运气够好，一步成功。

8、如果运气不是很好，基本上都不会很好，那么它会提示你：

Error in library(ShinyDash) : 不存在叫‘ShinyDash’这个名字的程辑包

• 解决方法：安装ShinyDash[3]

install.packages("devtools")
devtools::install_github("trestletech/ShinyDash")

• 还可能会提示你，安装ShinyDash不成功，因为还有几个预先文件没有下载，我在这里出的问题就是没有下载package'XML'

install.packages('XML')

• 更惨的是会提醒你，XML is not avaliable，那么[2]

install.packages("XML", repos = "http://www.omegahat.net/R")

• 如果这样依旧下载不了，就只能像上面一样，指定URL下载了

packageurl <- "http://www.omegahat.net/R/bin/windows/contrib/3.5.1/XML_4.0-0.zip"
install.packages(packageurl, repos=NULL, type="source")

• 最后再次安装ShinyDash

devtools::install_github("trestletech/ShinyDash")

计划通！

9、再次全选，Run App（这一次是在运行muxViz），会蹦出一个网页，就在这个网页里输入数据进行可视化就可以了。

 

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[1] 参考了一个写安装MuxViz的教程：https://www.neusncp.com/user/blog?id=80

[2]参考如何把XML安装到我这个该死的R版本上，https://stackoverflow.com/questions/26042751/cannot-install-package-xml-to-r

[3]有些人的安装语句不一样，主要是devtools的版本不一样吧，这里附上github上的安装语句https://github.com/trestletech/ShinyDash