题目描述
一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。
给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串
输入:
AACTGTGCACGACCTGA
5
输出:
GCACG
代码如下:
a = input()
n = int(input())
m = len(a)
res = 0
re = []
for i in range(m - n + 1):
buff = a[i:i+n].count("G")+a[i:i+n].count("C")
if res < buff:
res = buff
re = a[i:i+n]
print(re)