1.DNA序列

最新推荐文章于 2021-09-09 11:20:25 发布

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本文介绍了一种方法，在给定的DNA序列中找到GC-Ratio最高的子序列，长度至少为指定值。该过程涉及计算子序列中G和C字母的数量，以及整个序列的总长度来确定GC-Ratio。此技术在基因工程中有广泛应用。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

参考代码：

#include <iostream>
#include <string>
using namespace std;
double Ratio(string a)
{
	int num=0;
	for (int i=0;i<a.size();i++)
		if (a[i]=='G'||a[i]=='C')
			num++;
	return (double)num/(double)a.size();
}
int main()
{
	string s;
	int len,start;
	double max=0;
	cin>>s;
	cin>>len;
	if (len>=s.size() ||len<2||s.size()==0)
		return -1;
	for (int i=0;i+len<s.size();i++)
	{
		string str=s.substr(i,len);
		if (Ratio(str)>max)
		{
			max=Ratio(str);
			start=i;
		}
	}
	cout<<s.substr(start,len)<<endl;
}