qq_26628975的博客

CUDA10.2（10.0能用，但如果命令里面写cudatoolkit=10.0，pytorch是cpu版的，不好改过来）condainstallnumpy=1.21(monai依赖numpy>=1.17,pytorch>=1.7.0)没有对应cuda10.0的命令，重装10.2嫌麻烦，尝试直接用10.2的cudatoolkit，结果可行。1.pytorch安装。2.monai安装。...

cv2.imwrite写jpg图像会引入噪声，而写png图像就不会，差点被坑。猜测可能因为jpg是压缩格式？

用Pyradiomics提取的影像特征很多都是0和1（下图excel表），这样看起来不太正常，可能也会影响建模结果。原因是归一化的问题。需要修改参数文件*.yaml。如果设置了归一化 normalize: True（或者自己进行归一化），那么灰度值范围在0-1之间，此时如果设置了binWidth: 32（其他值也一样），那么就会产生以上情况。这是因为程序会将灰度值按每间隔32归为1个bin，也就是0-32归为1个灰度级，依次类推。所以有两种解决方法：1.binWidth: 32...

>>> s = 'as32{ vd"s k!+'>>> ''.join(x for x in s if x.isalpha())'asvdsk' >>> filter(str.isalpha, s) # works in python-2.7'asvdsk'>>> ''.join(filter(str.isalpha, s)) # works in python3'asvdsk'

import pypinyin# 不带声调的(style=pypinyin.NORMAL)def pinyin(word):s = ''for i in pypinyin.pinyin(word, style=pypinyin.NORMAL):s += ''.join(i)return s# 带声调的(默认)def yinjie(word):s = ''# heteronym=True开启多音字for i in pypinyin.pi...

#single channel image# shape of img is [x, y]# repeat as three channels# shape of img_3channel is [x, y, 3]img_3channel = np.repeat(img[..., np.newaxis], 3, 3)

import osimport SimpleITK as sitkdef resampleVolume(outspacing, vol): """ 将体数据重采样的指定的spacing大小\n paras： outpacing：指定的spacing，例如[1,1,1] vol：sitk读取的image信息，这里是体数据\n return：重采样后的数据 """ outsize = [0, 0, 0] # 读取文件的size和sp.

GLCM特征时出现bug：IndexError:arrays used as indices must beof integer (or boolean) type解决方法：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics/issues/634也就是：Downgrading numpy from1.19to1.18by running:pip install numpy==1.18It extracted everything fine....

DWI序列图像包含高低b值的DICOM图像，经常需要将高低b值DICOM图像分开以便后续计算。一般来讲DWI图像DICOM TAG里面的b值读取按以下规则：https://www.na-mic.org/wiki/NAMIC_Wiki:DTI:DICOM_for_DWI_and_DTI即按机器厂家区分：Philips: b_value (0018,9087) ----- 0 1000 （这也是DICOM标准推荐的tag）SIEMENS: b_value (0019,100C) -----...