ISCE2+MintPy+PyAPS安装（一篇搞定）

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已于 2023-10-12 22:15:59 修改

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分类专栏：学习记录文章标签： python ubuntu

于 2023-08-31 02:51:27 首次发布

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一.安装conda

1.下载conda
到清华大学开源软件镜像站下载安装包：
这里跳转：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn

2.在用户文件夹下新建一个名为anaconda的文件夹，并将刚刚下载的文件放在此文件夹中

3.右键点击文件夹，点击在终端中打开；或者直接CTRL+ALT+T打开终端，找到你刚创建的文件夹

4.输入下面命令行

bash Anaconda3-2021.11-Linux-x86_64.sh

5.出现提示，输入yes，并按回车键

6.出现提示就按提示输入Y或者yes，不出现提示就一直按回车，直到安装完成，输入以下代码

conda list

如果出现一堆包，就是安装成功了

二、安装ISCE+MintPy+PyAPS

1.在home文件夹下创建tools文件夹

mkdir -p ~/tools; cd ~/tools

2.关闭终端，然后重新打开一个新的终端；（这一步是为了让方才的设置生效）

3.在终端中输入以下命令：
安装了几个工具，如wget、git、tree和mamba 后面安装会用到这些工具。

conda config --add channels conda-forge
conda config --set channel_priority strict
conda install wget git tree mamba --yes

4.安装ISCE
这里搬运Yunjunz贡献的安装文件conda_envs（ https://github.com/yunjunz/conda_envs ），直接用就好，不用再次配置

（1）从github下载源码

cd ~/tools
mkdir isce2; cd isce2
mkdir build install src; cd src
git clone https://github.com/isce-framework/isce2.git

cd ~/tools
git clone https://github.com/aria-tools/ARIA-tools.git
git clone https://github.com/insarlab/MintPy.git
git clone https://github.com/insarlab/PySolid.git
git clone https://github.com/insarlab/PyAPS.git
git clone https://github.com/yunjunz/conda_envs.git

FBI WARNNING！！！注意：

github服务器在国外，如果下载太慢或者失败，建议逐一手动下载；

复制.git前面的地址，

比如复制并粘贴 https://github.com/isce-framework/isce2 到浏览器地址栏，可以打开isce2源码文件；

点击绿色的Code按钮——Download，

下载完了是一个.zip压缩包,

把它们逐一解压缩到~/tools文件夹；

（此时也要注意，下载的压缩包解压后可能会更改文件夹名，需要手动更改回来，例如MintPy可能会变为MintPy-main，不更改会报错）

（2）创建虚拟环境
利用conda创建一个虚拟环境，比如‘insar’：

conda create -n insar python=3.9 --yes
conda activate insar

（3）配置依赖库并安装isce和mintpy等
首先是isce2：

mamba install -y --file conda_envs/insar/requirements.txt --file MintPy/docs/requirements.txt --file ARIA-tools/requirements.txt isce2

如果此处报错，请检查并核对上面命令行中文件的存放路径是否正确，也要检查requirements.txt文件名是否被更改，如果被更改就修改命令或者文件名

如果此处报错"Command ‘mamba’ not found."，方法一：用conda替换；方法二：下载mamba

然后是mintpy等：

python -m pip install -e MintPy
python -m pip install -e PySolid
python -m pip install -e PyAPS

最后是用pip安装conda源中没有的依赖项

ln -s ${CONDA_PREFIX}/bin/cython ${CONDA_PREFIX}/bin/cython3
python -m pip install scalene
python -m pip install ipynb

（4）配置环境变量
这一步直接使用yunjunz提供的配置文件就可以了，非常方便；

只需要在环境变量的配置文件，使用如下命令打开 ~/.bashrc

sudo gedit ~/.bashrc

在最后添加以下命令创建一个alias来方便激活环境和配置文件：

alias load_insar='conda activate insar; source ~/tools/conda_envs/insar/config.rc'

（5）测试安装
打开一个终端（Ctrl+Alt+T），输入：

load_insar

（如果此处报错，返回（4），查看alias中的路径是否有错误）
激活环境，并在终端中逐一输入以下命令：

topsApp.py -h            # 测试ISCE-2
smallbaselineApp.py -h   # 测试MintPy

如果看到提示信息，说明安装成功了！（恭喜您进入了InSAR的深渊巨坑）