手把手教你用UNet训练自己的医学影像数据集(避坑指南)

前言:为什么你的UNet总训不好?(真实血泪教训)

老铁们!今天要分享的是我在医院做肝肿瘤分割项目时总结的UNet训练经验(含完整代码)。当初我可是在数据准备环节踩了无数坑(连续三周模型精度上不去!!!),现在把最干的干货整理给大家,看完至少节省80%的调试时间!

一、数据集准备的正确姿势(90%的人第一步就错了)

1.1 医学影像的格式转换黑科技

CT/MRI的DICOM文件转PNG千万别直接用OpenCV!会丢失窗宽窗位信息(血泪教训)!正确做法:

import pydicom
from pydicom.pixel_data_handlers import apply_voi_lut

def dicom_to_numpy(ds):
    # 关键参数设置(不同设备要调整)
    if hasattr(ds, 'WindowWidth'):
        ds.WindowWidth = 400  # 腹部CT常用窗宽
        ds.WindowCenter = 40  # 窗位
    return apply_voi_lut(ds.pixel_array, ds)

1.2 标注工具的选择(亲测对比)

  • ITK-SNAP:适合3D标注但学习成本高
  • Labelme魔改版(推荐):我修改的版本支持nii文件标注,GitHub搜索"labelme-medical"

(超级重要)标注保存时一定要检查mask是否为单通道8位图!遇到过标注显示正常但训练时发现mask全黑的诡异bug…

二、数据增强的隐藏技巧(让模型精度暴涨的秘诀)

2.1 不只是旋转翻转!医学影像专用增强:

from albumentations import (
    ElasticTransform, GridDistortion, RandomGamma,
    Compose, HorizontalFlip, Rotate
)

train_transform = Compose([
    Rotate(limit=20, p=0.5),
    ElasticTransform(alpha=120, sigma=120*0.05, 
                    alpha_affine=120*0.03, p=0.3),
    GridDistortion(p=0.3),
    RandomGamma(gamma_limit=(80,120), p=0.5),
    HorizontalFlip(p=
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值