11、社区驱动的本体演化：基因本体案例研究

社区驱动的本体演化：基因本体案例研究

1. 引言

社区驱动的本体构建已在多个领域的案例研究中得到应用，如支持组织工作、娱乐社交的环境，以及语义维基的基础设施等。语义网方法和知识门户的发展为社区驱动的本体演化提供了知识表示和共享的技术基础。随着在线社区的发展，理解社区如何随时间推进共享知识、测量和预测本体演化速率，以及这些速率与社区成功或协作成果的关联变得日益重要。

生命科学领域是社区驱动语义网应用的重要领域，因为生命科学家之间需要交换大量领域相关信息和数据。基因本体（GO）项目是社区驱动本体创建和演化的典型案例。GO 联盟提供了涵盖分子生物学多个领域的结构化、受控词汇和分类，供社区免费用于基因、基因产物和序列的注释。GO 社区在本体的共识构建和协作方面领先于其他社区，其本体规模大、动态变化率高、发展历程长且参与人数众多，是社区驱动语义应用的重要案例。

本文旨在观察社区驱动的本体演化在实际中的实施情况，识别该方法的成功之处和面临的挑战。通过分析 GO 社区的本体构建过程、跟踪 GO 随时间的动态变化，以及确定社区参与与 GO 演化、时效性和表示之间的关联，我们将探讨如何进一步推动本体演化以更好地满足用户需求。

2. 社区的目标与活动

许多社区的创建是为了实现特定目标，GO 社区也是如此。然而，社区网络环境运行后，其实际用途可能与创建者设定的目标不同，“用途”甚至可能重新定义社区“目标”。例如，软件开发者可能发现社区以产品未设计的方式使用其功能，从而将满足这些意外用途作为进一步开发的目标。

在社区环境中，目标和用途的主要交互层次包括：
- 个人用户层面：“使用”，即人们如何使用社区环境。
- 社区层面