25、基于知识的生物信息决策支持系统：原理、实现与应用

基于知识的生物信息决策支持系统：原理、实现与应用

1. 系统架构概述

系统主要由对象层、控制层和接口层构成。
- 对象层 ：规则编码了系统能为用户提供的策略和启发式方法，这些规则可从不同来源提取，目前规则集的核心是大量科学论文的集合。
- 控制层 ：包含执行器模块，它根据输入数据运行对象层的工具。执行器由推理器控制，并将中间结果更新到知识库，最后将最终结果发送给用户。
- 接口层 ：用户通过图形用户界面（GUI）和包装器查看系统操作。包装器管理控制层执行器与GUI之间的通信，GUI接收用户交互并将消息发送给包装器，包装器对消息进行格式化后发送给执行器模块，并向推理器发送查询，这样便于在不影响系统其他部分的情况下更改GUI。

2. 决策模块

为使系统更高效和结构化，知识库的事实和规则被组织成一组决策模块。
- 模块定义 ：决策模块是具有共同特征的特定事实和规则的集合，每个模块有明确的范围和目的，是决策过程的特定部分。例如，有适用于预处理操作、可视化、聚类等决策的模块，可用于不同应用领域。
- 模块组织 ：所有模块以树状结构组织，代表模块之间的专业化或泛化关系。模块可以有一个或多个子模块，父模块负责激活其子模块。树的每一层代表不同的元推理级别，父模块决定子模块的激活，子模块则在更专业的活动中进行决策。
- 模块激活机制 ：模块激活（也称为聚焦）由特殊规则管理。当规则的前提条件（IF部分）满足时，其