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QE计算后对电荷密度进行Bader 电荷分析，有两种途径
一种是使用CRITIC2软件，链接https://github.com/aoterodelaroza/critic2
为开源程序，可以进行量子计算后bader电荷的分析，也可当做linux中的计算器用，可以开方以及求正弦等运算。
CRITIC2的编译安装比较简单，最好用GNU的编译器，ifort支持不好，gfortran和gcc，g++的版本最好在6。否则make环节会出现错误。
安装发现gfortran5和7版本都会在make出现问题。
pymatgen安装配置全指南：从环境适配到生产级部署
pymatgen作为材料基因组学核心Python库，本质是面向第一性原理计算的工程级基础设施，而非即装即用工具。其运行依赖底层科学计算栈（NumPy/SciPy）、外部计算引擎（VASP/Quantum ESPRESSO）及材料数据库（Materials Project）三重耦合，导致安装失败、API调用异常、结构解析错误等高频问题。技术价值在于实现计算流程自动化与结果可复现，广泛应用于晶体结构分析、高通量DFT输入生成、材料数据库查询及结构相似性匹配等场景。本文聚焦pymatgen真实部署中的conda/
纯干货：Bader电荷分析 | VASP零基础实用教程
VOL一列的序号与POSCAR中的原子行数相对应，CHARGE一列即代表剩余电荷，然后根据需要分析的原子的价电子数总数减去剩余电荷，即可求出失去的电子数目，进而求出该原子对应的化合价。通过VASP进行Bader电荷分析主要包括以下步骤，首先需要对结构进行优化，然后基于优化的结构进行静态计算，最后通过“BADER CHARGE ANALYSIS”软件处理数据（下载链接附在文末），得到Bader电荷分析的结果。根据自己的操作系统选择相应的格式的文件下载，我们使用的时Linux格式的软件。
Soft-Actor-Critic2比较靠谱的代码版本(PyTorch)和梯度更新/不收敛等问题(附完整详细的每一部分代码)
网传版本有很多，但是存在诸多问题譬如:1.算法不收敛2.由于值网络的更新导致策略网络无法更新3.SAC效果不好 这导致了笔者未在网络上找到一个代码可以同时的在三种机器人控制(游戏)环境:"BipedalWalker-v3","LunarLanderContinuous-v2","Pendulum-v1"上表现很好 ，笔者进行了错误汇总并进行了代码附属和实现，以弥补这个缺漏。
第一性原理||计算Bader电荷（附脚本资源文件）
他对原子的定义是基于电荷密度，使用所谓的零通量面来分裂原子。第一列，是原子的序号，这和POSCAR中原子的顺序一致。每个原子的电荷大小是CHGCAR这一列所对应的数值，这是原子价层电子中的电子总数。AECCAR0是指芯电子电荷密度，AECCAR1是初始的价层电子电荷密度，AECCAR2是SCF收敛之后的价层电子电荷密度。我们在分析结构的电荷特性时，经常利用VASP计算bader电荷，从而可以得到原子周围的电子数，从而近似得到原子的化合价。例如，封闭在巴德体积内的电荷是一个很好的近似于一个原子的总电子电荷。
简单VASP计算INCAR设置（结构优化OPT、静态自洽SCF、能带BAND、态密度DOS）
改变 K 点、NBANDS、晶胞、ENCUT、POTCAR、自旋或 SOC 后要检查兼容性。该参数不参与物理计算，因此不会改变总能量、受力、应力或最终结构。如果研究的是金属、磁性材料、表面、二维材料、分子、缺陷、DFT+U、杂化泛函或强自旋轨道耦合体系，部分参数必须调整。适合已经用 IBRION = 2 预优化、力较小、自由度较多的结构。在 IBRION = 1、2、3 中，它只是内部缩放因子。“不能修改”不是程序禁止修改，而是修改后会改变理论模型、数值精度或能量参考，使结果不能直接比较。
Multiwfn实战指南：从键级到静电势的波函数分析
量子化学计算中，能量只是冰山一角，更深层的化学信息隐藏在波函数里。波函数分析通过解析轨道、电荷分布、成键特征等，为分子性质提供定量解释。Multiwfn作为一款免费、跨平台的通用波函数分析程序，极大简化了从键级、布居到静电势、QTAIM拓扑分析等一系列复杂任务。无论是判断亲电/亲核位点，还是研究弱相互作用，它都能给出标准化输出。本文从实际使用角度，分享Multiwfn的核心功能、实操套路与避坑经验，助你高效开展量化计算后的波函数分析。
VASP - Bader Charge Analysis
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CSCI8910Critics2
评论家2 Eclipse插件，用于搜索相似的程序更改并检测/修复丢失/不一致的编辑。 这是的扩展版本，称为CRITICS2。 CRITICS2不仅将允许代码审阅者总结相似的一致更改并发现任何不一致的异常，而且还允许代码开发人员自动缓解那些不一致的异常（即，应用缺少的更新或修复错误的更新）。 设置 安装Subclipse 1.8.x（）。建议使用Subclipse 1.8.x而不是1.6.x，因为在将Critics导出为可部署插件jar时，Subclipse 1.6.x可能会引入循环依赖关系。 安装GEF Zest 将gef-zest文件夹中的所有jar文件复制到Eclipse插件文件夹中，例如/ home / troy / eclipse-J2EE / plugins。 通过在eclipse.ini文件的第一行中添加“ -clean”，使用clean选项重新启动Eclipse。 记住在重
OC20 数据集完整指南：Open Catalyst 2020 的结构、任务、下载与在 fairchem 中的使用
Open Catalyst 2020（OC20）是 FAIR Chemistry（fairchem）开源仓库中面向多相催化场景的奠基性大规模数据集，包含 1.33 亿余条 DFT 计算结果，覆盖 S2EF、IS2RE、IS2RS 三大学习任务与 82 种吸附质。本文以 [docs/catalysts/datasets/oc20.md](https://link.gitcode.com/i/d426
评论家2：分析分子和固体中的量子化学相互作用
评论家2 概述 Critic2是一个程序，用于处理和分析分子和周期性固体中的结构和化学信息。 Critic2可用于读取和转换文件格式，以及对分子和晶体结构执行操作。 此外，comcritor2可以读取，分析和操纵多个标量场，在空间的每个点取值的三维函数，例如电子密度，自旋密度，ELF等。实空间标量场的拓扑分析，其中包括在分子理论中实现Bader原子：临界点搜索，盆地积分，盆地图等。其他相关技术，例如非共价相互作用图（NCIplots），实施的。 尽管电子密度是通常使用的电场批评家2，但是可以使用相同的技术分析任何其他电场（ELF，分子静电势等）。 因此，可以计算例如ELF盆内部的电荷或分子静电势的梯度路径。 可以使用crime2强大的算术表达式来计算新的标量字段。 Critic2旨在在基础电子结构计算之上提供抽象层。 不同的电子结构方法（FPLAPW，伪势，局部轨道等）以不同的方式表示电
手把手教你用UM982搭建厘米级RTK定位系统（附避坑指南）
本文详细介绍了如何使用UM982模组搭建厘米级RTK定位系统，涵盖硬件连接、软件配置和深度优化技巧。UM982支持BDS、GPS、GLONASS和Galileo等多系统全频点信号，特别适合精准农业、无人机导航等高精度应用场景。通过实战案例和避坑指南，帮助开发者快速实现厘米级定位精度。
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计算机在材料科学中的应用-上机实验二实验二 Office使用技巧?1 Word工具栏的增删与了解其主要作用(1) ? 把“常用”和“格式”工具栏打开(一般情况下是打开的！)，拖动到合适地方。打开和关闭“符号栏1”和“符号栏2”，了解其主要作用。步骤：执行菜单“视图/工具栏”命令，选取“常用”、“格式”、“符号栏1”、“符号栏2”后确定。关闭采用同样步骤，但改为不选。(2) 工具栏增删：在“常用”...
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Cytoscape.js 图论库实战指南：从一行代码建图到构建、测试与发布
Cytoscape.js 是面向可视化与分析场景的图论（网络）JavaScript 库，既能服务端在 Node.js 中做图分析，也能在浏览器中渲染可交互图。本文以项目 [README.md](https://link.gitcode.com/i/3e834291e98755857d5b8af8044c1108) 为主线，结合仓库源码，完整讲解从一行代码初始化图实例、理解内置布局与渲染架构，到执行
[STM32H750]HAL库下FMC驱动正点原子MCU屏的移植与优化
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水电站数字孪生：水力发电在可视化领域的应用
为智慧水坝领域提供了 B/S 架构的基于 WebGL 的图形引擎，与 GIS、粒子仿真、虚拟现实、边缘计算等技术相结合，融合多元业务系统数据，形成数字孪生界面，助力水利水电工程进一步提升数字化水平，乃至为整个工业领域添砖加瓦。
AI智能体驱动原子尺度研究：AtomisticSkills架构与实战
在材料科学与计算化学领域，原子尺度模拟是理解物质微观性质的核心技术，它通过第一性原理计算和分子动力学等方法，从原子层面揭示材料的结构与性能关系。其基本原理基于量子力学和经典力学，通过求解薛定谔方程或牛顿运动方程，预测材料的电子结构、力学行为和反应路径。这项技术的价值在于能够以低成本、高效率的方式探索庞大的材料设计空间，加速新材料的发现与优化。随着人工智能技术的发展，特别是大语言模型和强化学习的进步，科研范式正从传统的手动模拟向自动化、智能化演进。应用场景已扩展到新能源材料筛选、催化剂设计、药物分子优化等前沿
eCognition易康操作教程（二）：多尺度分割基于多光谱数据构建规则集，结合DSM高程数据提取建筑物、树木和绿地
一、数据 数据来源：教程中的实验数据，共包含RGB三个波段，还有数字地表模型（以下简称DSM）文件。 图一 RGB影像 数据特征：数据范围较小，要素种类少，仅包含较多的建筑和大片的绿地。由于建筑的房顶使用的材料和材料颜色不同，所以建筑的光谱特征没有规律，是不连续的特征。而绿地的光谱特征则十分容易分辨。 但是建筑通常具有规则的形状，而且建筑相比于周围其他要素...
Gemini 3.0 Flash：科研人的毫秒级学术推理引擎实战指南
大模型在科研场景中的应用，核心在于能否支撑可验证、可追溯、可复现的学术推理。Gemini 3.0 Flash并非轻量版通用模型，而是专为科研工作流深度优化的推理管道——它通过双通道动态路由机制，在毫秒级响应中实时调用Google Scholar结构化元数据，实现术语一致性校验、单位制合规检查与引用链完整性验证。其技术价值在于将文献处理、实验设计、论文写作等环节转化为‘问题切片+锚点引用+沙盒验证’的标准化流程，显著提升科研表达严谨性与数据溯源能力。典型应用场景包括跨学科文献矛盾挖掘、XRD/质谱等专业数据的
嵌入式工程师必学（52）：储能系统ESS
能量存储系统（ESS，Energystoragesystems）存在于各种各样的尺寸、形状和技术中。储能系统的技术，即基本的储能机制，自然会影响其重要特性，包括成本、安全性、性能、可靠性和寿命。然而，尽管基础技术很重要，但一个成功的储能项目依赖于对该技术的彻底和深思熟虑的实施，以实现项目的目标。成功的实施取决于储能系统的架构和组装情况。系统的体系结构可以决定其性能和可靠性，与它所使用的技术一致，甚至与之无关。
pymol 动画简单制作，gif、mp4导出
参考： https://www.youtube.com/watch?v=G77K9Lro8js1、直接Movie下Program下，Camera Loop下Nutate下选择，这里选择30degover4 sec；如果要动画过渡自然，可以在这4sec后面再Append 1sec；如果需要两个视角，既可以再把窗口蛋白定位到比如配体，不用管中间过程怎么定位过去配体，再Program下，Camera Loop下Nutate下选择，这里选择30degover4 sec添加；最后如果要整体形成个循环播放，可以在这4s
critic2：分子与周期固体结构分析的神器
critic2：分子与周期固体结构分析的神器 在化学与材料科学领域，处理和分析分子及周期固体的结构和化学信息是一项基础且重要的工作。今天，我要向大家推荐一个开源项目——critic2，它正是为此而设计的一款强大工具。 项目介绍 critic2 是一个用于操作和分析分子和周期固体中结构和化学信息的程序。它不仅能够读写和转换文件格式，还可以对分子和晶体结构进行多种操作。此外，critic2 可以读取、...
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腾讯云/阿里云服务器（Docker环境）：全自动跑脚本领京豆（无需本地代理，使用加速源）
Critic2 -- 读取siesta分子动力学结果
CRYSTAL SIESTA Si19-B.STRUCT_OUT #指定软件。首先创建脚本：convert.cri。
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本PDF共计22页，介绍的是操作驱动API，下载与否自己斟酌。
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Bader分析
一、背景 理查德·贝德（Richard Bader）开发了一种将分子分解为原子的直观方法。他对原子的定义纯粹基于电子电荷密度。Bader使用所谓的零磁通表面来划分原子。零通量表面是2D表面，其上电荷密度垂直于表面。通常在分子系统中，电荷密度在原子之间达到最小值，这是将原子彼此分开的自然位置。除了作为分子中原子可视化的直观方案外，Bader的定义通常也可用于电荷分析。例如，Bader体积...
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pgbader工具是对pg数据库运行日志的分析工具提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考。
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