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RSS订阅原创 真空能级与功函数
在DFT计算中，真空能级需要建立slab平板模型引入足够厚度的真空层来计算。晶胞CELL中留空的区域即是真空，电荷密度基本为0，所以是常数，即真空能级。但是在中，由于表面态的存在，而和是准确的。在中，和的差值是准确的。认为和是对应的（可用于标定），则可以得到真空能级和费米能级的差值，即功函数。
2025-04-08 19:55:56
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原创 费米黄金规则的推导
是否显含时间（常微扰虽然不随时间变化，但是其并不是从零时刻就存在的，而是在某一特定时刻突然施加给系统的，即看做是时间的一个阶跃函数，所以他仍然属于含时微扰）决定采取哪一种微扰。的状态造成任何修正，而是使原系统的状态持续地从一个变到另一个，即发生。以及跃迁速率表达式，再将常微扰的特殊情况代入，就得到费米黄金规则。1）是认为微扰的作用是造成未受到微扰的系统（即哈密顿量为。微扰不随时间变化的情况下，假设微扰作用时间足够长，对于光吸收问题，微扰为光子的吸收，即对应。于是跃迁速率（单位时间s内的跃迁概率）为。
2025-03-29 17:10:20
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原创 Ubuntu文件系统卡死（点击文件夹图标卡死）
按照其他博客的方法，尝试kill掉所有nautilus进程（killall nautilus）后。点击文件夹仍然无效。使用 Alt + F2 打开运行命令的对话框。输入 r 然后按回车 （重启Shell）点击文件夹图标，一直显示文件夹无响应。再次点击文件夹窗口，成功打开文件系统。输入nautilus试图启动也无效。
2025-03-24 09:28:55
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原创 电荷密度&差分电荷密度
TDED.Nsaverho 100 #设置每两次保存RHO的时间步间隔。若希望 .cube 文件不仅包含电荷/差分电荷信息，同时也包含体系结构信息，则 sisl 的命令为。TD输出的 .TDRho 文件需要重命名为 .RHO ,再通过 Sisl 进行转换。使用 Sisl 工具将RHO数据文件转化为 VESTA 可识别格式 .cube。前提：安装SIESTA的 Sisl 工具。生成 .RHO 文件和 .DRHO 文件。在VESTA打开生成的 .cube 文件。
2025-03-20 19:24:04
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原创 irREP安装与使用（计算波函数的对称性性质、不可约表示）
使用conda能很方便的安装，conda的安装查看#创建环境，并进入该环境#添加conda-forge通道#搜索irrep包#安装。
2025-03-19 21:33:54
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原创 ubuntu安装CUDA（自留）
source ~/.bashrc后验证是否成功。右上角可看到支持的CUDA版本为12.4以下。选择合适版本，按照其提供的步骤下载即可，例如。取消选择Driver后选择Install。若出现以上警告，选择Continue。下载显卡驱动，sudo sh 安装。接下来把CUDA加入环境变量。加入安装成功后提示的路径。安装完成后打开图形界面。重启并检查驱动是否安装。
2025-03-16 16:12:43
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原创 linux 计算 常用命令记录（自用）
cat” 命令能够抓取右侧指定的文件内容输出，若抓取多个文件，则第二个文件内容会在第一个文件输出末尾接着输出。”为后台运行符，能够将命令放到后台执行，释放终端。“>>”同样为输出重定向符，但是不清空右侧跟随文件，而是将左侧输出内容追加到右侧文件末尾。使用16个线程运行任务，任务内容为调用pw.x执行文件，向其输入scf.in文件内容。">" 为输出重定向符，会清空其右侧跟随的文件，将左侧输出内容填入右侧。“|tee”将输出重定向到scf.out文件内，同时也输出到当前终端上。
2025-03-15 16:51:37
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原创 oneapi安装QE
3,貌似2025的oneapi加载环境变量后，就无法正确链接到MKL库，因此另外安装MKL库。7，最后安装即可（将安装到configure时的--prefix路径）6，正确生成了make.inc后，可以开始构建QE可执行文件*.x。以 -j 开启并行构建，后面的数字为构建时使用的线程数。重要的几个有：pw.x，ph.x，epsilon.x。5，configure以生成make.inc文件。使用-a --cli进行无图形化界面安装。从输出检查是否正确连接到MKL库与并行环境。4，下载解压进入QE文件夹。
2025-03-14 01:12:44
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原创 QE源码安装（openmpi+MKL数学库）
（安装时，有sudo则安装路径为/opt/intel/oneapi/下；无sudo则安装路径位于/home/username/intel/oneapi/）开始配置，其中--prefix=/opt/qe-7.3制定安装路径；-enable-openmp为启用openMPI并行编译。1，安装gcc和gfortran编译器，以及其他依赖。如果没有，则需要向./configure命令指明。2，安装openMPI。4，下载解压qe安装包。在官网下载.gz安装包。
2025-03-13 20:35:53
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原创 Anaconda安装Siesta,QE
1，创建新环境2，进入环境，添加conda-forge通道3，安装依赖4，搜索siesta应该显示类似这样的结果5，选择一个版本安装6，验证。
2025-03-13 00:01:56
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原创 Anaconda安装与简单使用
需要改变安装路径就直接输入路径然后回车(安装在非本用户目录需要在运行.sh脚本时加上sudo)希望关闭(开启)自动激活，则在conda环境下使用命令(开启则改false为true)需要每次启动终端自动激活base环境的话，在~/.bashrc文件加入。在官网下载Anaconda的安装脚本，运行。不需要改变安装路径的话，就直接回车。需要输入yes就输入。
2025-03-12 15:46:08
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原创 Ubuntu-24.04安装OpenMpi
如果显示路径指向了openmpi的bin路径，则完成安装。--prefix指定的是之后install的安装路径。1，在官网下载OpenMpi的.tar.gz压缩包。编译时间中等，此处使用36线程编译大约花费5min。openmpi的编译需要gcc与make。
2025-03-12 15:07:40
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空空如也
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