用intel的oneapi包编译cp2k最终make报错(dbcsr的问题)

在ubuntu22上安装cp2k,gcc默认版本gcc-11, cp2k使用版本2022.1

cp2k安装方法采用tool/toolchain内install_cp2k_toolchain.sh

安装前准备:已经安装intel oneapi的base(包含c和c++以及mkl等)和hpc(包含fortran编译器)的2023.2版本,自从2024年后,intel提供oneapi内c编译器为icx, c++为icpx,fortran为ifx,后者不再提供ifort,因此编译安装openmpi等包时,仅需提供CC=icx CXX=icpx FC=ifx等即可编译安装,但是测试后发现会和其它平台版本匹配上有很多错误,所以这里依旧安装了带有ifort的intel oneapi版本,即2023.2的base和hpc包。并以此安装了openmpi。

安装cp2k: 在tool/toolchain内

./install_cp2k_toolchain.sh --math-mode=mkl 

会识别当前系统的gcc等,以及mip环境,还有intel的mkl等

随后安装一系列包,最后按照提示,使用 make命令后,会编译错误,如

compilation aborted for dbcsr_machine.F90 (code 1)

make[] : ***[...dbcsr_machine.o] 错误1

发现问题可能是exts/下的dbcsr的问题,会导致并行版本的cp2k如psmp等报错。发现只要使用oneapi mkl,则无法解决。

因此,最终使用openblas和不用intel编译器的openmpi成功安装cp2k。

./install_cp2k_toolchain.sh --math-mode=openblas

其中openblas安装错误,可以更换版本,个别包安装报错,一般都是gcc版本问题,对cp2k2022.1,建议使用gcc-12,个别报错可用gcc-11,最终make用gcc-12

<think>好的,我需要回答用户关于如何编译CP2K问题。用户提到了几个引用,我需要结合这些引用内容来提供准确的指导。首先,引用[2]详细描述了在Ubuntu 22.04下编译CP2K-2024.1的步骤,括源码和第三方库的处理。引用[3]提到了在曙光超算平台上的尝试,特别是AMD GPU版本的编译问题和解决方法,比如使用HIP子程序。引用[1]则强调了掌握这些编译知识对使用CP2Q的重要性。 我需要先整理引用中的关键步骤。根据引用[2],用户需要下载源码和第三方库,解压后放入指定目录,建立build目录。可能还需要安装依赖项,如编译器、MPI库等。然后,配置编译选项,比如使用特定版本的GCC或Intel编译器,并行计算相关的设置。接下来是编译过程,可能需要执行make或类似的命令。最后是验证安装,运行测试案例确认编译成功。 另外,引用[3]提到AMD GPU编译问题,用户可能需要处理DBCSR和HIP相关的配置。这里可能需要指导用户如何启用GPU支持,比如在编译时添加特定的选项,或者修改Makefile来含HIP子程序。同时,要提醒用户注意可能遇到的段错误,建议检查依赖库的版本兼容性或者尝试社区推荐的解决方法。 用户可能需要分步骤的指导,括环境准备、源码准备、配置、编译、验证等。同时,需要指出不同平台(如Ubuntu和曙光超算)的差异,尤其是在处理GPU支持时的不同步骤。还要强调常见问题,如第三方库的路径设置、编译选项的正确性,以及如何处理编译中的错误,比如段错误可能需要调试工具或查阅社区资源。 最后,根据用户提供的引用,需要正确标注引用来源,比如在提到源码准备时引用[2],在讨论GPU编译问题时引用[3],并在总结时引用[1]强调掌握编译的重要性。同时,生成的相关问题应围绕编译中的常见挑战、优化方法、不同平台的差异等,帮助用户进一步探索。</think>### CP2K编译指南 #### **1. 环境准备** - **系统要求**:推荐使用Linux系统(如Ubuntu 22.04)[^2]。 - **依赖安装**: - 安装基础编译工具:`gcc`, `g++`, `make`, `cmake`。 - 安装并行计算库:`MPI`(如OpenMPI或Intel MPI)[^1]。 - 安装数学库:`BLAS`, `LAPACK`, `ScaLAPACK`,推荐使用Intel MKL或OpenBLAS。 --- #### **2. 源码与第三方库准备** 1. **下载源码**: - 从[CP2K官网](https://www.cp2k.org/)下载最新源码(如`cp2k-2024.1.tar.gz`)[^2]。 2. **解压源码**: ```bash tar -zxvf cp2k-2024.1.tar.gz ``` 3. **第三方库处理**: - 将下载的第三方库(如`libint`, `libxc`, `ELPA`)放入`tools/toolchain/build`目录,若无此目录需手动创建。 --- #### **3. 编译配置** - **使用工具链脚本**: ```bash cd tools/toolchain ./install_cp2k_toolchain.sh --with-libint=yes --with-libxc=yes ``` 脚本会自动生成`arch`文件(如`Linux-x86-64-gfortran.popt`),需复制到`cp2k/arch`目录。 - **GPU支持(可选)**: - 若需编译AMD GPU版本,需启用`DBCSR`和`HIP`支持,在配置时添加`--with-gpu=hip`[^3]。 - 注意:AMD GPU编译可能因驱动或库版本问题导致段错误,需检查依赖项兼容性。 --- #### **4. 编译执行** 1. **进入源码目录**: ```bash cd cp2k/makefiles ``` 2. **选择编译版本**: - 优化版本:`make ARCH=Linux-x86-64 VERSION=popt -j8` - 调试版本:`make ARCH=Linux-x86-64 VERSION=psdb -j8` - `-j8`表示并行编译(根据CPU核心数调整)[^1]。 --- #### **5. 验证安装** - 运行测试案例: ```bash cd tests ./do_regtest.py ``` - 检查输出文件是否含`OK`状态,确保编译成功[^1]。 --- #### **常见问题** 1. **第三方库路径错误**: 确保第三方库路径正确,并在工具链脚本中指定`--mpi-mode=no`(若无需MPI)。 2. **段错误(AMD GPU)**: 尝试更新HIP驱动或使用社区提供的补丁。 3. **依赖冲突**: 使用`conda`或虚拟环境隔离依赖库版本。 ---
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