带有spacing保存数据

最新推荐文章于 2025-07-22 15:12:10 发布
最新推荐文章于 2025-07-22 15:12:10 发布
阅读量2.5k 收藏
点赞数
CC 4.0 BY-SA版权
文章标签： python 计算机视觉 深度学习
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/mvpboy123/article/details/123112680
这段代码演示了如何使用numpy从二进制文件读取数据，然后进行切片并保存到新的二进制文件中。接着，将数据转换为SimpleITK图像，设置间距，并最终保存为.nii.gz格式的医学影像文件。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

# P = np.fromfile(r'C:\Users\320133514\Desktop\2-16\softmax\48-nnunet.bin', dtype=np.float32)
# P.shape = 48, 320, 320
# img = P[24:48, 0:320,0:320]
# img.tofile(r'C:\Users\320133514\Desktop\2-16\softmax\1\24-nnunet-result.bin')
# print(C)
# print(C.shape)
# print(type(C))
# print(C.ndim)
# out = sitk.GetImageFromArray(img)
# spacing = [0.69531298,         0.69531298, 1]
# out.SetSpacing(spacing) # 设置spacing，这一步别忘了
# sitk.WriteImage(out,r'C:\Users\320133514\Desktop\C-0-24.nii.gz')
玩转数据可视化之R语言ggplot2：（十五）主题设置：使绘图更美观
阿里云专家博主、数据科学领域优质创作者、统计er在读
07-22 2万+
ggplot2设置个性化主题，使绘图更美观
matlab数值溢出该怎么解决?
**My Coding Family**
07-10 1054
🏆本文收录于「Bug调优」专栏，主要记录项目实战过程中的Bug之前因后果及提供真实有效的解决方案，希望能够助你一臂之力，帮你早日登顶实现财富自由🚀；同时，欢迎大家关注&&收藏&&订阅！持续更新中，up！up！up！！
图像处理（ITK）
qq_51039912的博客
07-18 404
ITK图像处理，Dice损失，HD损失的计算
ITK对应python中SimpleITK库的常用函数举例
热门推荐
jancis的博客
05-19 2万+
在医学图像上经常使用的一个库-SimpleITK，很多处理都只懂个大概或者只会简单的读取，保存图像，这里对常用的一些操作进行总结： 1、
SimpleITK常用指令
sinat_30618203的博客
06-02 2547
imo 1、查看数据类型 img_itk.GetPixelIDTypeAsString() 2、修改数据类型 sitk
图像文件加载与保存2（包括自然图像，灰度图像，JP2图像）
ZXQ_JAY的博客
07-26 424
nib、sitk加载保存图像
【SimpleITK】胸部CT数据3D space归一化，以及3D plot
m0_37477175的博客
06-03 7534
样例数据 ori_file = '1.nii.gz' 使用sampleITK读取数据,注意SimpleITK 加载数据是channel_first。 import SimpleITK as sitk ds = sitk.ReadImage(file) img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds) np.shape(img_array) (229, 512...
文件与数据
singhwong
12-22 671
@[TOC]1. 文件与目录 #(1) 文件/目录操作的相关类型 与文件/目录操作有关的类型主要分布在Windows.Storage命名空间及该命名空间下的子命名空间中。下面列出了与文件/目录操作有关的几个重要类型。 StorageFile 表示一个文件类型，通过该类，可以对某个文件进行一些常用操作，例如重命名、删除、获取基本属性等 StorageFolder 表示一个目录实例，可以对某个目录进行重命名、复制、删除等操作 KnownFolders 一个静态类型，公开一系列静态属性，通过这些属性可以直接获取
``` import QtQuick 2.12 import QtQuick.Window 2.12 import QtQuick.Controls 2.12 import QtQuick.Layouts 1.12 Window { visible: true width: 1920 height: 1080 title: qsTr("Hello World") Rectangle { width: 600 height: 400 // 表格数据模型 ListModel { id: tableModel ListElement { col1: "1"; col2: "A"; col3: "100" } ListElement { col1: "2"; col2: "B"; col3: "200" } ListElement { col1: "3"; col2: "C"; col3: "300" } } Column { spacing: 1 anchors.fill: parent // 表头 Row { spacing: 1 Repeater { model: ["编号", "名称", "数值"] Rectangle { width: 200 height: 40 color: "#3498db" Text { text: modelData color: "white" anchors.centerIn: parent } } } } // 数据行 Repeater { model: tableModel Row { spacing: 1 property int rowIndex: index // 当前行索引 Repeater { model: 3 // 3列 Rectangle { width: 200 height: 40 color: index % 2 ? "#ecf0f1" : "#bdc3c7" TextInput { anchors.fill: parent anchors.margins: 5 text: { // 根据列索引获取对应字段值 switch(index) { case 0: return modelData.col1 case 1: return modelData.col2 case 2: return modelData.col3 } } onTextChanged: { // 更新模型数据 var newData = tableModel.get(rowIndex) switch(index) { case 0: newData.col1 = text; break case 1: newData.col2 = text; break case 2: newData.col3 = text; break } tableModel.set(rowIndex, newData) } } } } } } } } }```为这段代码加入点击“提交”按钮，将输入到文本中的数据保存为.doc文档
04-01
考虑到.doc文件本质上是二进制格式，而用户可能只是想保存数据，可能更简单的是保存为纯文本或CSV，但用户明确要求.doc。另一种可能是生成RTF格式的文件，因为RTF是一种文本格式，可以保存为.doc扩展名，并且大多数...
读取和保存nifti图像之nibabel与SimpleITK的区别
qq_41663215的博客
07-26 2118
nibabel读取.nii或.nii.gz import nibabel as nib file_path = '/home/.../motion_102_0000.nii.gz' # file suffix can also be .nii data = nib.load(file_path) voxel_ndarray = data.get_fdata() #读取成numpy array print(voxel_ndarray.shape) output: (x,y,z), 如（19.
SimpleITK使用——2. 进行crop操作
啷个哩个啷
05-06 4263
参考： Stack Oveflow：SimpleItk crop image ITK forum：Simple ITK Crop Image ITK forum：How to crop a 3D image with a specified size? Github issue：SimpleITK/SimpleITK SimpleITK document：Image Grid Manipulation
SimpleITK 对与Dicom 文件的矩阵的插值
qq_36339966的博客
01-31 5354
最近在做毕业设计，然后涉及到了Dicom文件的3D矩阵处理。 这个矩阵是一个512 * 512 * 203 的矩阵，voxel spacing 是 0.895375 * 0.895375 * 2.49997，要插值成spacing是0.5 * 0.5 * 0.5 的一个3D矩阵。 首先我试了Matlab 里面的插值函数 interp3，以及griddate，但是往往在meshgride这个函...
医学图像处理教程
BLvren_的博客
05-28 639
参考医学图像处理教程系列：https://cloud.tencent.com/developer/article/1652244 医学图像处理软件包 SimpleITK SimpleITK中的图像概念与计算机视觉中的图像差异是非常大的，后者是简单的多维矩阵，前者中图像是表示一种真实的物理实体，图像中的每一个像素都表示了是真实物理空间中的一个点，不仅仅有像素值，还有坐标，间距，方向等概念。 SimpleITK读取医学图像 读取dicom序列文件，用ImageSeriesReader() # read d
【SimpleITK】使用区域生长法/种子填充法/形态学分割肺-CT img
m0_37477175的博客
02-05 7343
import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt 导入数据： img_path = “...” img = sitk.ReadImage(img_path) img.GetSize() (512, 512, 121) img_arr = sitk.GetArrayFromImage(img) plt.imshow(img_arr...
python---之sitk中的Getspacing,origin,direction
zxyhhjs2017的博客
06-18 8810
itk_img = sitk.ReadImage(img_file) img_array = sitk.GetArrayFromImage(itk_img) # indexes are z,y,x (notice the ordering) center = np.array([node_x,node_y,node_z]) # nodule center origin = np.arra...
关于DICOM Tag(0018,0088) Spacing Between Slices缺失的解决方法
inter_peng的专栏
08-02 6485
该文由Markdown语法编辑器编辑完成。一、问题提出在读取医学影像序列的Dicom Tag信息时，有几个Tag是与图像的像素信息相关的。如 Pixel Spacing(), Spacing Between Slices()等。 Pixel Spacing是由两个值构成的数组，表明每一张Dicom影像的x方向和y方向上的像素间距。而由于MR或CT等数据是三维的，因此在构建后的三维体数据vtkIm
用算法思维了解一个停车点的车辆情况
Buy0515的博客
07-20 651
如果你希望了解一个停车点的车辆情况，你需要有一些网络知识，了解 APP 和相关软件服务器之间的通讯协议，当了解了具体的接口之后就可以写一个包含循环的程序来定时判断某一个点的车辆数量信息，这个程序可以用 Python 来完成，涉及到的库不会超过 2 个，基本就是。对于这样的操作来说，真的只需要。
同时安装了 Python 3.8.20 和 Python 3.12.3如何指定默认版本
最新发布
m0_71071763的博客
07-22 188
0 /usr/bin/python3.12 2 自动模式。1 /usr/bin/python3.12 2 手动模式。2 /usr/bin/python3.8 1 手动模式。有 2 个候选项可用于替换 python3 (提供 /usr/bin/python3)。要维持当前值[*]请按<回车键>，或者键入选择的编号：2。
深入解析与实战应用：利用Python和Amazon Product Advertising API实战分析
2503_92516413的博客
07-21 664
在电商平台的运营中，关键词搜索接口是不可或缺的一部分，特别是在亚马逊这样的全球电商平台。请注意，你需要将<你的API_KEY>和<你的API_SECRET>替换为实际获取的API密钥。为了使用亚马逊的API接口，你需要获取API密钥，这包括API密钥（Key）和API密钥密文（Secret）。首先，你需要访问亚马逊开发者中心，注册一个开发者账号，并获取相应的API权限。API限制：亚马逊的API可能有请求频率限制，确保你的请求频率符合其规定，以避免被封禁。API_KEY = '<你的API_KEY>'
arcgis读取matlab数据
02-17
### 如何在 ArcGIS 中导入或读取 MATLAB 数据文件 #### 使用 ASCII 文件作为中介 一种常见的方式是在 ArcGIS 和 MATLAB 之间通过 ASCII 文本文件交换数据。MATLAB 可以方便地将矩阵或其他变量保存为文本文件，而 ArcGIS 支持多种文本格式的输入。 ```matlab % 将 MATLAB 矩阵写入 CSV 文件 data = rand(10); % 创建随机数矩阵为例 filename = 'output.csv'; csvwrite(filename, data); ``` ArcGIS 能够直接读取这种 `.csv` 或其他分隔符分割的纯文本文件，并将其转换成栅格或者其他空间数据结构[^4]。 #### 利用 TIFF 图像格式传输地理信息 当涉及到带有地理位置属性的数据集时，可以考虑使用 GeoTIFF 这样的标准图像格式来进行传递。MATLAB 提供了 `geotiffwrite()` 函数用于写出带地理坐标的 TIFF 文件，在此过程中还可以指定 NoData 值等参数[^1]： ```matlab R = georefpostings([size(Z), spacing], [minX minY]); geotiffwrite('myGeoTiffFile.tif', Z, R, ... 'WriteMode','overwrite',... 'Compression','none',... 'GeoKeyDirectoryTag',{... 'ModelTypeGeoKey',[1],'Projected';... 'ProjLinearUnitsGeoKey',[9001]}); ``` 上述代码片段展示了如何设置投影坐标系统以及线性单位等内容。之后可以在 ArcGIS 中无缝加载这些由 MATLAB 生产出来的 GeoTIFF 文件[^2]。 #### 导出 Shapefile 格式的矢量数据 对于矢量类型的地理特征（比如点、线或多边形），可以通过导出 shapefiles 来实现互通。虽然 MATLAB 自身并不内置支持创建完整的 shapefile 组合包的功能，但是借助 File Exchange 上的一些工具箱是可以做到这一点的。一旦有了 .shp 文件及其配套文件 (.dbf,.shx)，就可以很容易被 ArcGIS 打开并进一步分析处理。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

Fly*Boy

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值