Carthagene安装

最新推荐文章于 2021-05-01 16:16:23 发布

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最新推荐文章于 2021-05-01 16:16:23 发布 · 1.1k 阅读

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#遗传连锁图 #QTL

本文详细记录了在CentOS6上安装Carthagene的过程，包括依赖包的安装、软件的运行以及解决Plotchart版本错误的问题。安装完成后，可以通过命令行启动CarthaGene的图形和命令行界面。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

Carthagene安装
最近在写文章，需要用carthagene做遗传连锁图。记录下安装过程。
下载地址：
http://mulcyber.toulouse.inra.fr/frs/download.php/1199/carthagene-1.3.beta-Linux-x86_64.sh
我的是centos6，所以我下载的是x86_64
当然安装之前需要安装一些依赖包:
• tcl
• tk
• tcllib
• tklib
• itcl
• itk
• bwidget
• iwidgets
• blt
• tclreadline or tclx (prefer tclreadline if available; command history is not available when using tclx.)

或者直接安装ActiveTcl (at least 8.4)。
不安装ActiveTcl ，需要使用 yum install 安装依赖包
安装完依赖包之后，可以直接运行
./carthagene-1.3.beta-Linux-x86_64.sh
注意你的安装路径，安装之后会出现两个文件夹 bin和share
，bin下就一个carthagene 命令，可加入到全局环境变量里，
share下有一个 carthagene文件夹，需要使用下面的命令拷贝
cp /share/carthagene /usr/share/carthagene
至此，安装完毕。
可以在命令行输入：
• To start the command-line interface (CarthaGene shell), run