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msw521sg
这个作者很懒,什么都没留下…
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在线绘制基因表达热图
在线绘制基因表达热图昨天需要画基因表达热图(heat map), 想起一个在线的网站可以很方便的绘制,提供大家。不用R代码,这个工具绝对可以画出你想要的那样。网址是:https://software.broadinstitute.org/morpheus/原创 2017-07-11 23:55:11 · 30913 阅读 · 3 评论 -
基因表达模式聚类以及可视化
最近在使用RNA_seq数据做些分析,结果得到了大量差异表达以及共表达的基因,如何合理展示这些基因也是一件不简单的事情。除了常见的热图(heatmap)展现形式,今天在推荐另外一种展示方式(上图C)。需要R包TCseq或者Mfuzz。我这里给出的代码是基于TCseq。 输入文件就是一个基因表达量的矩阵,如下图。 代码也很简单,见下图,也请点击阅读原文查看代码。 library(TCseq)原创 2017-07-19 21:44:18 · 21680 阅读 · 2 评论