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麦瘟病(wheat blast)​ 　　今年看到过几次有关麦瘟病的研究论文。第一次看见的时候还很好奇，特地查了一下。几天前在science上看到一篇关于麦瘟病研究的论文。文章题目是“Evolution of the wheat blast fungus through functional losses in a host specificity determinant”。文章主要讲了这个病

第一个接近完整的六倍体小麦基因组今天在bioRxiv看到刚在线的有关小麦基因组的文章。文章题目是“The first near-complete assembly of the hexaploid bread wheat genome,Triticum aestivum”。看到文章作者和单位的时候，我有点不淡定了。作者不太熟悉，猜测应该不是和IWGSC那伙人是一起的。作者单位包括约翰斯·霍普金斯大学

野生二粒小麦基因组在science发布​ 　　现代小麦是世界上的三大粮食作物之一，由于其基因组和复杂，它的基因组研究远远落后于水稻和玉米，迄今还没有一个较好的参考基因组发布。不过随着测序成本和技术的进步，今后一段时间小麦及其祖先种的基因组会陆续发布。我们餐桌上的小麦是一个异源六倍体物种，经历一系列的驯化才变成今天的小麦。研究已经表明六倍体小麦是由3个2倍体祖先种间2次种间杂交而来。第一次杂交形

SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes 详细的说明请阅读：http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html一， 安装：首先在家目录下， 下载安装包wget h