本文详细介绍了如何使用Freesurfer工具进行脑成像分析，特别是从扩散张量成像（DTI）的FA数据出发，通过mri_vol2surf和mri_segstats命令将FA配准到表面并提取aparc.annot分区模板下的平均FA。步骤包括将FA配准到大脑表面，然后使用mri_segstats获取每个分区的统计信息，最后通过shell脚本提取特定分区的平均FA值，生成CSV文件进行比较和分析。
Freesurfer提供了基于分区模板提取常规特征（area, volume, thickness, thicknessstd, meancurv, gauscurv, foldind, curvind）的指令mris_anatomical_stats+aparcstats2table还有可以提取从fMRI或DWI产生的结果以及一些特殊的结构特征（如LGI）的指令mri_segstats。
常规特征的提取比较简单，将mris_anatomical_stats+aparcstats2table结合使用即
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