细胞角蛋白显微镜图像中的上皮区域检测与EGFR内吞分析
在细胞研究领域,对上皮区域的准确检测以及对细胞内吞过程的深入分析至关重要。下面将分别介绍细胞角蛋白显微镜图像中的上皮区域检测方法,以及基于时间序列图像的EGFR内吞分析系统。
上皮区域检测
上皮区域检测主要通过各向异性扩散金字塔(ADP)和最大稳定极值区域(MSER)算法实现。
1. 各向异性扩散金字塔(ADP)
- ADP利用各向异性扩散的边缘锐化特性和多分辨率分层处理的性能。各向异性扩散能平滑物体内部并去除暗孔,通过金字塔的粗级别不断填充间隙。
- 从粗到细的表示中选择合适的分辨率级别,实验表明第4级(w = 174,h = 128)是能提供提取相关信息所需最少细节的最大级别。
2. 最大稳定极值区域(MSER)算法
- 在图像中,明亮的圆形区域代表上皮区域,间质细节分布在隐窝之间。由于各向异性扩散,“甜甜圈”中间的像素强度因小孔而降低,全局或自适应阈值无法提供稳定结果。
- MSER算法检查所有阈值并提取连通分量,通过区域面积变化判断其稳定性。稳定性公式为:
[
\Psi(R_{i}^t)=\frac{|R_{i}^{t - \Delta}| - |R_{i}^{t + \Delta}|}{|R_{i}^t|}
]
其中,(\Delta)(实验中(\Delta = 15))是稳定性范围参数,(\vert\cdot\vert)表示区域面积。
- 满足以下三个属性的区域为MSER +:
- 极值性:连通区域内的所有像素比周围像素亮。
- 稳
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