多重检验校正

在多个假设检验中,控制I类错误(假阳性)的概率变得至关重要。Bonferroni校正通过降低p值阈值以严格控制假阳性率,但可能导致真阳性丢失。相比之下,FDR(False Discovery Rate)校正允许一定程度的假阳性,以平衡发现的真阳性数量。FDR中的q值用来衡量在多次检验后的假阳性率,Benjamini-Hochberg方法是常用FDR校正方法之一。

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多重检验校正
总结:
(1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正
(2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了,从而使得结果更加严谨
(3)FDR校正是对每个p-value做校正,转换为q-value。q=p*n/rank,其中rank是指p-value从小到大排序后的次序。

单次检验的I类错误
假设检验是用于检验统计假设的一种方法,其基本思想是“小概率事件”原理,即小概率事件在一次试验中基本上不会发生。
假设检验的基本方法是提出一个空假设(null hypothesis),也叫做原假设或无效假设,符号是H0。一次检验有四种可能的结果,用下面的表格表示:
在这里插入图片描述
Type I error,I类错误,也叫做α错误,假阳性。
Type II error,II类错误,也叫做β错误,假阴性。
多次检验使得犯I类错误概率增大
在传统的假设检验中,单个检验的显著性水平或I型错误率 (错误拒绝原假设的概率)为计算出的P-value。但随着检验次数的增加,错误拒绝原假设的概率即I型错误率大大增加。
例如:如果我们进行了m次假设检验ÿ

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