28、在复杂层面描述蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中的直系同源信号

在复杂层面描述蛋白质 - 蛋白质相互作用网络中的直系同源信号

在生物学研究中，了解蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络中的直系同源信号对于揭示生物进化和功能具有重要意义。下面将详细介绍相关的研究内容和结果。

1. 聚类数量统计

研究中使用了 MCL 和 SiDeS 两种聚类方法，对不同的聚类组（GYC、OYC - E、RYC - E、OYC - W、RYC - W、OYC - F、RYC - F、OYC - H、RYC - H）的聚类数量和预测因子数量进行了统计，结果如下表所示：
| Cluster Group | MCL #Clusters | MCL #Predictors | SiDeS #Clusters | SiDeS #Predictors |
| — | — | — | — | — |
| GYC | 365 | 147 | 122 | 93 |
| OYC - E | 37 | 14 | 5 | 3 |
| RYC - E | 34.31 (±3.82) | 12.69 (±2.96) | 4.71 (±2.08) | 3.8 (±1.76) |
| OYC - W | 181 | 80 | 66 | 46 |
| RYC - W | 175.22 (±7.21) | 67.85 (±5.87) | 55.04 (±5.57) | 40.32 (±4.54) |
| OYC - F | 191 | 80 | 64 | 51 |
| RYC - F | 181.97 (±7.51) | 70.32 (±6.01) | 57.71 (±5.57) | 42.25 (±4.49) |
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