Combine xml files into xls(for TCGA clinical data) on MacOs

最新推荐文章于 2025-12-26 14:31:53 发布
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本文介绍了如何在MacOS系统上从TCGA官网获取临床数据XML文件，并通过R语言将这些文件合并成XLS格式。首先下载所需文件，包括gdc-client、gdc-manifest和metadata，然后在终端执行命令提取XML文件并打包。最后，通过R脚本将XML数据转换为临床数据表格。
  1. 去TCGA官网搜索你想要的数据关键词并把xml添加购物车。

例如我搜索LIHC

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