搭建caffe环境时“error: hdf5.h”找不到的解决方法

本文介绍了解决在安装Caffe过程中遇到的HDF5相关错误的方法。通过正确配置Makefile.config和Makefile,指定了正确的HDF5包含目录和库文件,解决了找不到hdf5.h的问题。

搭建caffe环境时,在最后进行 ”$make all” 操作时,报错找不到 “hdf5.h”,找了半天原因,是因为在安装 “hdf5” 的时候使用的指令是

$ sudo apt-get libhdf5-serial-dev

所以相应的需要更改"Makefile.config"文件中的包含目录

ctrl+f 找到


INCLUDE_DIRS:=$(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
然后在后面加上"serial"的包含目录,即:
INCLUDE_DIRS:=$(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include/usr/include/hdf5/serial/
接着需要更改相应的"Makefile"文件,找到
LIBRARIES +=glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_hl hdf5
更改最后两项为:
LIBRARIES +=glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_serial_hl hdf5_serial
就可以了,继续make了。

### 编译 Caffe 解决 `hdf5.h` 文件缺失问题 当在编译过程中遇到 `fatal error: hdf5.h: No such file or directory compilation terminated.` 错误,通常表明系统中未正确安装 HDF5 库及其头文件。以下是解决问题的方法: #### 方法一:通过包管理器安装 HDF5 开发库 大多数 Linux 发行版提供了预构建的 HDF5 软件包,可以直接使用系统的包管理工具来安装。 对于 Ubuntu 或 Debian 系统,可以运行以下命令: ```bash sudo apt-get update sudo apt-get install libhdf5-dev ``` 这会安装 HDF5 的开发版本以及必要的头文件和静态链接库[^1]。 #### 方法二:手动下载并安装 HDF5 如果无法通过包管理器获取合适的 HDF5 版本,则可以选择从源码编译安装。 1. **下载 HDF5 源码** 访问官方网站 https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/ 下载最新稳定版本的 HDF5 压缩包。 2. **解压并进入目录** ```bash tar -xvzf hdf5-*.tar.gz cd hdf5-* ``` 3. **配置、编译并安装** 运行以下命令完成安装过程: ```bash ./configure --prefix=/usr/local/hdf5 make sudo make install ``` 4. **设置环境变量** 需要确保编译器能够到新安装的 HDF5 头文件和库文件。可以通过修改 `.bashrc` 文件实现这一点: ```bash echo 'export PATH=/usr/local/hdf5/bin:$PATH' >> ~/.bashrc echo 'export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/hdf5/lib:$LD_LIBRARY_PATH' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc ``` 这样就完成了 HDF5 手动安装的过程[^2]。 #### 方法三:调整 OpenCV 和其他依赖项中的配置 某些情况下,即使已经成功安装了 HDF5,仍然可能因为项目特定的路径查机制而未能检测到该库。此可以在项目的 CMakeLists.txt 中显式指定 HDF5 的位置或者像 OpenCV 那样直接编辑 common.cmake 文件加入以下两行代码: ```cmake find_package(HDF5 REQUIRED) include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIRS}) ``` 上述操作适用于需要额外支持 HDF5 功能的情况,比如 OpenCV 的 Python 绑定模块[^4]。 经过以上任一种方式处理之后再次尝试执行 `$ make all` ,应该不会再碰到关于 `hdf5.h` 的错误提示[^3]。 --- ###
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