HoloViews教程:使用表格数据集进行数据可视化分析
前言
在数据可视化领域,表格数据(Tabular Data)是最常见且通用的数据格式之一。Holoviews作为一款强大的Python可视化库,为处理和分析表格数据提供了简洁而高效的解决方案。本文将深入讲解如何使用HoloViews处理表格数据集,并通过实际案例展示其核心功能。
表格数据基础
表格数据(也称为列式数据)类似于电子表格的布局方式,其中:
- 列代表变量或维度
- 行代表观测值
HoloViews支持多种表格数据格式,包括:
- Python字典形式的NumPy数组
- pandas DataFrame
- dask DataFrame
其中,pandas DataFrame是最为灵活和强大的格式之一。
数据准备与加载
首先,我们需要导入必要的库并加载示例数据:
import numpy as np
import pandas as pd
import holoviews as hv
from holoviews import opts
# 初始化HoloViews扩展
hv.extension('bokeh', 'matplotlib')
# 加载疾病数据集
diseases = pd.read_csv('../assets/diseases.csv.gz')
这个数据集记录了美国各州不同年份的麻疹和百日咳发病率。数据集包含5列:
- Year(年份)
- Week(周数)
- State(州名)
- measles(麻疹发病率)
- pertussis(百日咳发病率)
创建HoloViews数据集
为了明确数据的结构和含义,我们需要创建一个HoloViews的Dataset
对象,并声明:
- 关键维度(kdims):独立变量
- 值维度(vdims):依赖变量
vdims = [('measles', 'Measles Incidence'), ('pertussis', 'Pertussis Incidence')]
ds = hv.Dataset(diseases, ['Year', 'State'], vdims)
这里我们使用了(name, label)
的元组形式为值维度提供了更友好的描述。
数据聚合处理
由于我们只关心年度平均值,可以对周数维度进行聚合:
ds = ds.aggregate(function=np.mean)
数据可视化
基础曲线图
我们可以将数据集转换为曲线图元素:
layout = (ds.to(hv.Curve, 'Year', 'measles') + ds.to(hv.Curve, 'Year', 'pertussis')).cols(1)
layout.opts(opts.Curve(width=600, height=250, framewise=True))
这里创建了两个曲线图,分别显示麻疹和百日咳的发病率随时间变化,并垂直排列。
数据选择与条形图
我们可以选择特定州和年份范围的数据,并以条形图展示:
states = ['New York', 'New Jersey', 'California', 'Texas']
bars = ds.select(State=states, Year=(1980, 1990)).to(hv.Bars, ['Year', 'State'], 'measles').sort()
bars.opts(opts.Bars(width=800, height=400, tools=['hover'], xrotation=90, show_legend=False))
数据分面展示
HoloViews提供了多种分面展示方式:
- 网格布局:将各州数据分别显示在网格中
grouped = ds.select(State=states, Year=(1930, 2005)).to(hv.Curve, 'Year', 'measles')
gridspace = grouped.grid('State')
- 叠加显示:将多条曲线叠加在同一坐标系中
ndoverlay = grouped.overlay('State')
数据聚合分析
我们可以计算年度平均发病率和标准差:
agg = ds.aggregate('Year', function=np.mean, spreadfn=np.std)
errorbars = hv.ErrorBars(agg, vdims=['measles', 'measles_std']).iloc[::2]
overlay = (hv.Curve(agg) * errorbars).redim.range(measles=(0, None))
总结
通过本教程,我们学习了:
- 如何在HoloViews中加载和处理表格数据
- 如何声明数据维度结构
- 多种数据可视化方法
- 数据选择和聚合技巧
HoloViews的表格数据处理能力强大而灵活,能够满足从简单探索到复杂分析的各种需求。掌握这些基础技巧后,你可以进一步探索HoloViews更高级的功能,如交互式控件和多维数据分析。
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考