Deep Learning in Neuroscience 01

1. 前言

这个系列会总结深度学习在神经生物学中的应用，从基本的图像处理开始。
第一步，配置环境。

2. 配置深度学习环境

我使用的系统是 Fedora 33， 显卡NVIDIA GeForce GTX 1080 Ti。

2.1 安装NVIDIA显卡驱动

通过 dnf (rpm) 安装过nvidia driver.

2.2 安装CUDA

按照官网给出的命令执行，出现小问题。

问题出现在红色框处，命令行提示出现冲突。

解决办法：
将红色框的命令替换成

sudo dnf module disable nvidia-driver

问题出现的原因：
系统已经安装了NVIDIA 显卡驱动，重复安装会出现冲突；另外，在执行

sudo dnf -y install cuda

时，会默认安装cuda中自带的NVIDIA显卡驱动，同样也会导致出现冲突。所以，通过禁止安装cuda中自带的驱动，解决问题。

Reference

• https://ask.fedoraproject.org/t/dnf-update-nvidia-error/8864
• https://rpmfusion.org/Howto/CUDA#Which_driver_Package

2.3 检测环境配置

在命令行运行

nvidia-smi

3. 安装Anaconda，Pytorch和Jupyter

Anaconda: 直接按照官网说明进行安装https://docs.anaconda.com/anaconda/install/linux/

成功创建一个conda环境之后，就可以安装pytorch和相关工具。
参考http://bartek-blog.github.io/python/pytorch/conda/2018/11/12/install-pytorch-with-conda.html