今天新学到的Linux命令

最新推荐文章于 2024-10-31 02:07:00 发布
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本文介绍如何使用sudo及rstudio-server进行权限切换和启动RStudio服务。通过R-metpeaks包进行m6A甲基化位点分析的过程，包括创建目录、设置工作路径以及调用metpeak函数进行数据分析。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

sudo -s 转到root权限

su XXX是转到自己的权限

rstudio -server start 打开rstudio的端口

locate WT1 | less  定位找到WT1这个文件，然后再打开查看一下


之前安装了R-metpeaks   这个最好打开网络端来做

首先创立一个目录用来存放结果，不然之后找不到

getwd()

setwd()

做m6A的分析：最后得到的Input文件和IP文件的last.bam文件

IP_BAM=c('last.bam文件路径')

Input_BAM=c('last.bam文件路径')

metpeak(注释文件GENE_ANNO_GTF='

路径Homo_sapiens.GRCh38.83.gtf',IP_BAM=IP_BAM,INPUT_BAM=Input_BAM,EXPERIMENT_NAME='自己创立的最终存放的文件夹')

知道是在那个基因上面

fengleqi
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