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RSS订阅原创 R装包vignette 错误
R@TOCR 包安装错误hecking vignette meta-information … ERRORE> Output(s) listed in ‘build/vignette.rds’ but not in package:装一些生信报的时候出现上面的错误比如：MeTPeak，devtools。。。。。错误内容类似PS.我这个针对服务器上的由原本的命令instal...
2019-09-26 11:32:20
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原创 当R安装包package ‘XXX is not available (for R version 3.5.1)
遇到这个情况，说明包源不在或者改了地方，那就换个办法呗比如corrplot就这样子安装：source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("corrplot")library("corrplot")哦，还可以自己去官网下载本地安装，具体咋做以后再说补充哈...
2019-08-16 17:29:17
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原创 处理大文件---1
#大文件处理最近需要处理上百G的文件，速度很重要。对于读取有以下一些看法目前我用的是#!/usr/bin/python3import timeprint(time.strftime('%Y-%m-%d %H:%M:%S',time.localtime(time.time())))def ProcessLargeTextFile(filename): head='' re...
2019-04-30 11:42:21
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原创 老曹的作业本之sra转fastq
如何让sra 转fastq快一点由于之前下载的数据比较大，转fastq从财务跑了一趟回来还没转完一半，想着有没有快点的办法，人老了，心浮气躁。后来找到这个,2018年6月出来，这么久了我还没更新，可见我真的懒了很久了。于是下下来试一下,这边的机子是Ubuntu，就下那个吧。以前centos 和小红帽等都用过，怎么安装加载路径这里我就不说了，下次出个集合。ls *.sra |while re...
2019-03-07 16:52:49
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原创 老曹的作业本之-双向链表元素的删除
老曹的作业本之-双向链表元素的删除def output(listvalue,listright,head): print(listvalue[head]) Next=listright[head] while Next != -1: print(listvalue[Next]) Next=listright[Next] ...
2019-02-26 10:56:28
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原创 老曹的作业本之-单链表插入元素
老曹的作业本之单链表插入元素单链表插入元素单链表插入元素然后插入一个元素有几点关键的问题1.插入的这个元素在value的哪个位置不重要（listvalue.append(4)），但是要带尾巴，即下标，下标指向原本这个位置上个元素下标指向的下标（listright.append(listright[perpos])）2.插入的这元素的上一个元素的下标由原来的改成现在这个元素所在的位置（lis...
2019-02-20 16:06:04
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原创 老曹的作业本开始啦~~~
很久很久以前，就打算写博客，写公众号，观望了很久，迟迟不肯下手。始终不得进步的原因是没能很好的按照计划进行，尤其是过年回家，爸爸说我小时候读书很认真，每天的作业一定要做完才睡觉，想想高三那年确实有好多个夜晚在被子里赶任务才得以进步迅速。今天我生日，我不打算再等了，我已经受够了自己不按照计划完成任务的日子。所以取名叫老曹的作业本。以后的每个星期必须有一篇博文。我会把自己在年初计划写的...
2019-02-19 17:48:29
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空空如也
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