Orange3实战教程：单细胞---空间自相关评分器

空间自相关评分器

根据输入的基因表达数据计算 Moran’s I 或 Geary’s C 空间自相关得分。

输入

• 数据集：包含空间坐标和基因表达值的输入数据集。

输出

• 评分器：一个包含邻接矩阵和所选评分方法的 SpatialScorer 实例。

空间自相关评分器 为数据集中的每个基因计算空间自相关得分（Moran’s I 或 Geary’s C）。输入数据集必须包含基因表达值（列）和空间坐标（x 和 y 列）。邻接矩阵通过空间坐标的 k-近邻算法构建。每个基因的得分独立计算。

1. 输入数据信息：显示输入数据集的基本信息。
2. 空间坐标选择：选择提供每个细胞空间坐标的 X 列和 Y 列。
3. 方法配置：

• 选择空间自相关计算方法（Moran’s I 或 Geary’s C）。
• 指定邻接矩阵的近邻数量（k 值）。

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