揭示生物活性成分的新方法:QPAR - F 方法解析
在生物活性成分研究领域,探寻混合物中具有生物活性的部分是一项关键任务。今天要介绍的 QPAR - F 方法,为我们提供了一种有效的途径来发现这些生物活性成分。
1. 理论基础
1.1 PLS 模型的生物活性预测模型
在研究中,我们用矩阵 (X) 表示粗提物或样品色谱图的数据矩阵以及用于组合的划分区域,用向量 (y) 表示生物活性。它们之间的关系可以用以下公式表示:
(y = Xb + e)
其中,(b) 是回归系数向量,(e) 是误差向量。这里使用偏最小二乘法(PLS)来估计 (b) 并建立模型。
在 PLS 算法中,当使用 (k) 个 PLS 成分时,数据矩阵 (X) 会以类似于主成分分析的方式进行分解,生成得分矩阵 (T_k) 和载荷或因子矩阵 (P_k),(X) 的残差矩阵定义为 (E_k)。对 (y) 进行类似分析,会产生得分矩阵 (T_k) 和载荷向量 (q_k),(y) 的误差向量为 (f_k)。具体公式如下:
(X = T_kP_k^T + E_k)
(y = T_kq_k + f_k)
(T_k = XH_k)
最后,回归系数向量 (b) 的估计值为:
(\hat{b} = H_k(T_k^TH_k)^{-1}T_k^Ty)
通过这些方程,我们可以计算估计的生物活性:
(\hat{y} = X\hat{b})
对于新对象,其预测的生物活性可以通过以下公式获得:
(\tilde{y} {new} = X {new}\hat{b})
样本数据
QPAR-F方法解析生物活性成分
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