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RSS订阅原创 BOLD signal change _ROI 如何实现
下面的是教程 翻译一下就是：找个每个ROI 的平均 timecourse 找到baseline fixation 的平均timecourse 用ROI 的timecourse / baseline timecourse 每个条件下 onsets 的时间点的 平均这个条件的开始的时间点的 平均timecourse 遍历时间 差不多30秒的样子 其实20秒差不多了 例子思路：1.求出每个 ambiguity下的Bold 值 然后画点图 看下nii文件的时间进...
2020-11-09 19:08:58
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原创 pymvpa——如何计算一个普通列表的相似性矩阵
在计算roi的bold平均信号的rdm矩阵时，由于用rsa.PDist （）函数help(rsa.PDist )Function of mvpa2.measures.rsa moduleThis Measure returns the upper triangle of the n x n disimilarity matrix defined as the pairwise distances between samples in the dataset, and where n is the
2020-11-04 17:57:40
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原创 数据库Mysql 高效学习过程-只需5天
数据库学习过程1.安装和使用，官网下载Mysql，安装后如果需要 用户操作界面需要再次安装官网的WorkBench推荐B站教程：https://www.bilibili.com/video/BV1VE411x7fZ?t=955上 链接的教程只是下载Mysql 并配置的过程，再次强调没有用户操作界面，需要自行下载。2.写SQL语句 ，建议使用终端 直接上手写，概念过完就忘，看完视频和没看一样，需要动手敲代码才能记住推荐B站教程：https://space.bilibili.com/55..
2020-11-04 17:31:45
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转载 IDEA 快捷键
转自https://www.cnblogs.com/hkgov/p/12209317.html发现里面方法不全，再加两个，用的时候最好 用查找 Command+F or Ctrl+F 大发好1. Editing(编辑)快捷键 介绍 Ctrl +Space 基本代码补全，输入字母按后列出匹配的词组 Ctrl+Shift+Space 智能代码补全，列出与预期类型一致的方法或变量 Ctrl+Alt+Space 补全类名 Ctrl+Shift+Enter .
2020-10-30 15:30:29
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原创 python异步（并行）编程 听课笔记
1.进程和线程2. 同步和异步3.协程4.生成器到协程5.asyncio模块（协程模块）………………………………………………………………………………1.进程和线程进程相当于一个任务，比如做饭线程相当于操作，做饭需要解冻肉，洗菜，煮米饭一个进程任务，做饭下需要多进程 做饭的多个进程，如上GIL全局解释器锁是用在IO密集型（大量的文件读写，...
2019-08-11 22:42:16
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原创 行为科学统计——T检验
T检验与F检验：无论是T检验还是F检验，它们的目的都是检验样本平均数的。最终的目的都是用样本去推测总体F检验是利用方差来对两个或两个以上处理的样本平均数的检验，但是T检验只用于两种处理的情况T检验一般分为：单样本T检验（用一批样本去推测总体） 独立样本T检验（两批样本所代表的总体之间的关系的检验） ...
2019-08-06 10:44:04
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原创 NLP和深度学习笔记_概论和实现步骤以及包下载
https://www.bilibili.com/video/av42021445/?p=6卷积的过程就是特征提取的过程。机器翻译，聊天机器人，情感分类和语义搜索例子：将英文翻译成德文，就是利用的多层次递归神经网络 sequence to sequence需要：编码器+解码器 谷歌2017年提出来的深度学习在自然语言处理的步骤：1）论文的阅读，最新算法的研究...
2019-08-01 10:12:00
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原创 PyMVPA_manual 4.8 event related 设计的数据分析 笔记
4.8时间相关的实验设计与前几节不同的是，事件相关设计的数据分析时将time时间这一因素考虑进去了这里介绍两个方法：1）实验条件的建模和模型参数估计的分析2）时间空间数据样本的提取。4.8.1 事件相关设计数据的预处理不是事件相关的对于与事件相关的分析，大多数处理都是对从一组事件中派生出来的数据样本进行的。其余的数据可以被认为是无关的。然而，某些预处理只有在对完整的时...
2019-07-28 15:57:05
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原创 回归分析中的评估指标
图片来自https://www.bilibili.com/video/av35101467/?p=9在理解F检验时，查到的一些资料链接为https://wenku.baidu.com/view/1b673a6ab84ae45c3b358c73.html方差分析https://wenku.baidu...
2019-07-22 18:27:42
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原创 SPM_PPI心理生理交互作用讲解及实现
1.PPI是做什么的？PPI是用来检验两个ROI之间在任务状态下是否联系加强的一个工具，如果在实验条件下，这两个ROI之间的联系要显著大于在基线条件下两个ROI之间的联系，那么就认为这个实验任务引起了这两个ROI之间的交流加强。我的理解：实验条件就是引起心理反应的关键。而生理这个词 指的就是我们的ROI区域的血流动力学响应所以叫做生理心理交互作用2.PPI的操作流程解读2...
2019-07-19 10:47:07
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原创 mvpa2包中的vstack 可以将列表变成数据集
在处理fmri数据的时候肯定会遇到将不同的数据集分割后需要一个一个追加，但是想把他们按照列的方式叠加就是个问题了。举例子：append方法append是追加数据的意思引入两个包from mvpa2.suite import *from mvpa2.measures import *然后调用vstackd=vstack(d,a=0)现在d是fmri类...
2019-07-18 21:31:09
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翻译 PyMVPA_manual_6.2.4笔记
6.2.4 fMRI数据的Searchlight空间探照灯算法的最初思想来源于Kriegeskorte等人的一篇论文。(2006年)，并随后在一些研究中使用。探照灯最常见的用途是计算大脑中每个球状区域(ROI)的交叉验证分析。这种分析产生了一个分类精度的地图(通常)，通常被解释或后处理，类似于GLM统计输出图(例如，随后的分析与推理统计)。在本例中，我们将研究如何在pymvpa中进行这种类型的...
2019-07-16 10:28:25
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原创 PyMVPA_manual_4.4 -4.7分类和searchlight笔记
4.4分类器-All Alike, Yet Different在本章中，我们将从上一章Getting data in shape中继续我们的工作，以便复制Haxby等人（2001年）的研究。对于本教程，有一个小帮手函数，可以在以下情况下手动生成我们所生成的数据集：原始研究采用所谓的1-最近邻分类器，使用相关性作为距离测量。在pymvpa中，这种类型的分类器由knn类提供，这使得可以...
2019-07-15 16:02:22
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翻译 PyMVPA_manual 4.2&4.3基础知识和处理流程
所有环境和包全部准备完毕后，来看mvpa的数据结构所有volume的数据全部都保存在dataset中，所有的操作都离不开dataset,所以需要了解pymvpa中的dataset的数据结构4.2数据集基础和概念pymvpa中的大多数数据集被表示为二维数组，其中第一轴是样本轴，第二轴代表样本的特征。在最简单的情况下，数据集只包含数值矩阵的数据。在上面的示例中，数据矩阵中...
2019-07-12 16:23:12
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原创 偏导数，方向导数和梯度
偏导数：假设 f(x,y)=x+y**2偏导数就是在一个给定值（x0,y0）点初，先固定y的值，将y看成常数，对x求偏导相当于只有x一个自变量和求导数是一样的再固定x ,将x看成常数，对y求偏导相当于只有y一个自变量和求导数是一样的………………………………………………………………………………………………………………………………方向导数 的意思是 如果我有一个面,函数表达...
2019-05-31 16:30:58
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原创 安装pymvpa2时报错：swig.exe没有安装的一波三折及解决办法
只适用于windows在安装pymvpa2时一直不成功 我就试着手动下载了pymvpa2的包 解压放在了anaconda文件夹下Lib文件夹下的site-packages里面然而手动安装的时候也出错了一直提醒我要安装swig.exe 所以我屁颠屁颠的去下载了swig 但是没有用，说是要下载Microsoft Visual C++ 14.0 下载方法见博...
2019-05-29 22:04:18
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原创 程序员的数序1笔记_第一章 0的故事
第一章 0的故事指数：请记住这种思维方式：以简化规则为目的去定义值以简化规则为目的去定义值以简化规则为目的去定义值关于计数法的思考：古代只有1 11 111 1111这样的计算法，但是这样随着数越来越多，很难一眼看出来大小，就有了按位记数法（如 10进制，二进制）。但是随着数字的增大，100000和1000000哪个大，不能一眼就...
2019-05-28 22:39:40
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原创 Codehub的tensorflow学习笔记1_简单tensor,op和变量操作
课程源于bilibili上的Codehub的tensorflow课程 ……此笔记主要目的是自己理解和记录，如果能帮到其他人十分开心首先安装anacondapip install tensorflow #安装tensorflow了解基本概念 图是基于会话的session,图中有操作（operate，简称op）和数据(tensor)比较值得注意的是每次都需要初始化变量...
2019-05-28 11:18:44
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原创 unhashable type: 'list'
在我定义常量矩阵的时候我只加了一个[]#创建一个常量opm1=tf.constant([3,3])#创建一个常量opm2=tf.constant([2],[3])#创建一个矩阵乘法的op 把m1,m2 传入product=tf.matmul(m1,m2)print(product)结果报错：unhashable type: 'list'所以 我给每个list多加一个[]...
2019-05-28 10:37:50
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原创 达叔机器学习笔记1_逻辑回归建立一般流程
碎碎念：达叔说逻辑回归相当于小型的神经网络就是没有隐含层嘛先简单介绍一下需要做的事情 共分为7步，接下来将达叔作业里的所有程序粘贴出来1.,导入数据集，查看数据格式操作：train_set_x_orig, train_set_y, test_set_x_orig, test_set_y, classes = load_dataset() train_se...
2019-05-27 21:44:42
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转载 SyntaxError: invalid syntax
这样的错误一般是因为上一行的代码结尾，忘记加括号导致的如果加了一个括号不行，那你看看是不是少两个括号转自：https://blog.youkuaiyun.com/qq_41556273/article/details/81515018...
2019-05-27 21:21:33
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原创 for 循环里面出现TypeError: 'float' object cannot be interpreted as an integer 怎么办
Python3.7真的搞不懂 我的for循环里面连个除法都不涉及，怎么就存在浮点数了提示错误内容如下： File "C:/Users/stars/Desktop/temp.py", line 34, in aisprime for i in range(2,abs(number)):TypeError: 'float' object cannot be interpret...
2019-05-25 16:08:52
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转载 numpy模块重复安装怎么破
不知道自己在什么时候装了两个numpy模块 ……1.在Anaconda Prompt下输入pipuninstallnumpy；2.若不能删除，找到E:\python\Lib\site-packages的numpy文件，把它直接删除，然后重复第一步即可。3.pipinstall numpy重新安装numpy模块。这样就可以啦因为之前有两个模块的时候直接用Anacon...
2019-05-23 11:46:04
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原创 MATLAB 打开创建文件夹详细说明
在打开一个系统盘时，利用命令 cd ‘盘名：’ 命令创建 如 cd ‘D：’打开系统盘下的文件夹时 用 cd ‘C:\Program Files\MATLAB\R2017a\examples\matlab_featured’ 也可以一层一层的打开文件夹 cd ‘C:\Program Files‘ cd ‘MATLAB’ cd ………………返回上一级目录 用 cd ‘../...
2018-07-29 15:21:54
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转载 MATLAB 字符串处理
单引号‘’ 括起来的是字符串在matlab中 把字符串当作行向量来看的 在’khww’ 字符串中，如果需要加单引号，则用双引号来表示如i’m a student –> ‘i”m a student’(1)字符串的操作 格式： eval(s) s是个字符串 即将字符串s 当作matlab命令执行 如y=eval(‘sin(pi),cos(pi)’) 结果为 0...
2018-07-28 17:21:42
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转载 matlab 预定义变量和变量的管理
预定义变量是由matlab系统本身定义的变量（1）ans是计算结果的默认赋值变量 （2）i j 代表虚数单位 （3）pi 代表圆周率 （4）NaN 代表非数 在绘图时，如果想裁掉一部分，只需要将相应的坐标数据设为NaN就可以了变量的管理 (1）内存变量的删除和修改 可以在MATLAB工作区窗口中完成变量的管理，右击变量，选择相应命令，who 和whos 可以显示出...
2018-07-28 16:00:40
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转载 matlab 常用数学函数
1.三角函数 sind(角度) sin(弧度) 如：sind(90) sin(π/4)2.abs函数 用于求实数的绝对值，复数的模和字符的ASCII码值 3. 取整函数 fix() floor() ceil() round() fix() 取靠近0的整数 floor() 向下取整 ceil() 向上取整 round() 四舍五入取整 ...
2018-07-28 15:31:22
3215
空空如也
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