Materials Studio建模之初阶

本文介绍了如何使用Materials Studio软件进行氯化钠晶体结构的建模。通过两种方法,即从库导入和手动搭建,详细阐述了创建晶格模型的步骤,包括设置晶格参数、添加原子、查看晶体性质等。此外,还提及了调整3D显示形式和转换为最简单位胞的操作,为初学者提供了清晰的教程。
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  • 新建工程:打开Materials Sautio会问是要开始一个新project还是打开一个以前的

  • 选开启新的project,现在以氯化钠为例,以NaCl为名称

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注意:不要保存在C盘,不要用中文命名

视窗介绍——三个 Explorer

  • 从View的Explorer可见:Job Explorer、Project Explorer、Properties Explorer

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  • Job Explorer ,己完成的、正在跑的;显示运行的job,近端远程的状态都可以显示

  •  Project Explorer ,各种输入与输出文件,可以查看结果、修改输出入的相关设定;

  • Properties Explorer ,材料的原子及电子结构3D模型等物性数据,例如晶体晶胞边长、原子元素种类,键长键角,晶胞内原子数等。

得到NaCl晶体结构的两种方法

方法一:从MS库导入

可以通过file→ import打开进入structure内建的分类,找到已经建好的结构

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方法二:手动搭建

1、手动输入氯化钠的晶体结构。先打开new 要有晶胞,里面建立原子结构;选3d atomistic document,确定之一个空的3d对象的工作稿

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2、手工输入晶体结构:   Build菜单→crystal→Build Crystal根据icsd查询NaCl晶体的参数,输入进去:space group-点群:255  

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3、lattice parameter,填写晶格常数,比如a,b,c的值,以及三个角度, NaCl的a是5.64 

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4、Options里面其本上是预设就可以

orientation standard指晶胞在绝对坐标中的方向

按Build或者Apply就可以生成该结构的晶格模型了

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5、添加原子 

蓝色球按下去,就可以加原子 

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6、在Element中输入Na or Cl,可以直接输入,也可以按旁边的“…”直接出来元素周期表,找到元素即可,abc是分数坐标,根据icsd是零,按add就添加了Na原子。Cl 位置是0.5,0.5,0.5,也加上,这时我们就得到了NaCl的晶体结构

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7、查看性质—Properties 

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8、选Lattice 3D,可以看到一系列结构信息,角度α β γ、对称性、晶胞边长、空间群等,以晶胞 边长为例,双击可以修改 

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9、选Symmetry System,可以看到一系列结构信息,从cell formula可以看 到Na4Cl4,目前晶胞是一个八颗原子的氯化 钠晶胞,比例是1:1;还可以看见密度体积

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10、更改 3D 显示形式,鼠标右击,出现 Display Style

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11、更改 LABEL鼠标右击,出现label,可以选择显示多种标签,比如说某个或全部原子的化学符号,(element symbol),还可以选择字形的大小;可以设置,也可以remove掉标签。还可以输入一些文字

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12、做出来的晶胞并不是premitive unit cell,最小体积的晶体,可以在build菜单symmetry里面选premitive cell转成premitive,这样进行光学计算会提高速度,做能带计算更好

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至此,NaCl的结构搭建完成

简单构建表面

build---surface--- cleave surface, 输入你要截的表面、厚度crystal 构建真空

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