Materials Studio学习笔记(四)——分子建模

1 分子建模 

 本文学习笔记是参考B站UP主月只蓝的视频内容。

UP主的主页链接为

月只蓝的个人空间-月只蓝个人主页-哔哩哔哩视频

月只蓝的视频内容较为基础,适合初学者入门。

视频链接为: 【[月只蓝带你学Materials Studio] 建模篇 第3讲 晶体模型的构建-哔哩哔哩】

 1.1 晶体简介

晶胞可以分为两种,分为晶体晶胞和不定性晶胞。不定形的结构比较复杂。

构建晶体模型的必需的三方面信息。

  • 对称性信息:即空间群,一共有230个空间群。
  • 晶格常数:3个晶胞长度参数+3个晶胞角度参数,共6个。
  • 晶胞中原子类型及其三位坐标。

晶胞可以想象为长方体,长宽高就是晶格长度参数,凌和凌之间有夹角,这个夹角就是晶胞角度参数。在晶胞里面原子的三维坐标,缺一不可。 

如何通过网站获取这些必要信息呢?

(1)对于无机晶体:ICSD(The Inorganic Crystal Structure Database)

特点:海量无机晶体数据,包括常见金属、氧化物、矿物的数据、数据集成在软件Findit中。

(2)有机晶体:CSD(Cambridge Structural Database)

特点:海量的有机晶体数据,常见的有机物、药物、聚合物晶体、MOF、COF的数据。数据集成在CCDC中。

(3)矿物晶体:矿物晶体:AMCSD(美国矿物晶体结构数据库)网站

网站地址为:American Mineralogis

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