Anaconda环境部署常用命令

一、Anacond下载
下载地址：https://www.anaconda.com/download/

二、Anaconda prompt 命令行工具

三、环境操作相关
创建新环境
conda create -n envname（环境名） python=3.4（版本）

克隆环境
conda create -n envname2 --clone envname1

查询当前已创建的环境
conda info -e

切换环境
Linux : source activate envname
Windows：activate envname

注销环境
Linux：source deactivate
·Windows：deactivate

删除环境
conda remove -n envname --all

四、conda安装
conda list # 查看已安装的当前环境所有包
conda search fastqc # 查找特定包，查看软件版本
conda install fastqc # 安装包
conda install fastqc=0.11.6

配置镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

安装包时显示安装的频道
conda config --set show_channel_urls yes
查看已经添加的channels
conda config --get channels

已添加的channel在哪里查看
vim ~/.condarc
五、pip安装
pip install SomePackage # 未安装时直接安装最新版本
pip install SomePackage1.0.4 # 指定版本
pip install ‘SomePackage>=1.0.4’ # 最小版本
pip install -U SomePackage # 已安装情况下更新到最新版本
pip install SomePackage # 查看所有可安装版本

pip show SomePackage # 查看已安装软件版本号
pip uninstall SomePackage # 删除已安装包

Conda 安装使用图文详解（2021版）