Cassiel60的博客

library() install.packages()ls() list.files()rm(list=ls(all=TRUE))Esc中断当前命令的执行 tab 补全Ctrl+L清楚当前屏幕 Ctrl+up弹出历史命令框getwd() setwd()head() tail()?function()help(function)a...

打开.rda（rdata的简写）文件，可以用R.studio打开#R#对于比较不同组之间是否存在差别，用单因素方差分析法（ANOVA）# ll# 2019-03-14#对于安装报错的包，可以修改镜像为china(lanzhou)install.packages("car", dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))ins...

#加载sangerseqR包library(sangerseqR)#读入数据seq = readsangerseq('input.ab1')#读取碱基数据，0.33指的是将达到主峰0.33的次峰定义为杂合子峰bc = makeBaseCalls(seq, ratio = 0.33)#读主峰primarySeq(seq)#读次峰secondarySeq(seq)#输出...

KEGG -GO主要是使用R 中clusterProfiler包进行富集分析 以及使用pathview 包进行代谢途径整合和可视化。进行在线分析的：https://pathways.embl.de/1.代码：https://github.com/Cassiel60/R/blob/master/enrichment.r2.安装包：使用代码中的方法要多尝试几次，反正我第一次安装时就是安装...