
医学影像
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这个专栏包含医学影像的预处理方法,机器学习在医学影像中的应用等
Harvey Chui
haoyu_cui@outlook.com
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【代码已开源】从QuPath标注到WSI组织分割
WSI Segmenter 是一个基于轻量化分割网络DeepLab v3架构的病理切片肿瘤区域分割工具,可实现切片中 ROI(感兴趣区域)的分割,支持 QuPath 软件(版本 >= 0.4.2);该工具使用预训练的 ResNet 作为骨干网络,通过深度学习算法实现肿瘤区域分割。原创 2024-12-25 14:30:01 · 743 阅读 · 2 评论 -
【代码已开源】基于Python的全切片(WSI)染色归一化工具,实现了reinhard, macenko, vahadane共三种方法,支持GPU加速
为了应对数字病理切片受到不同中心、不同扫描设备的影响,先后有不同的研究提出了针对病理图像的染色归一化(stain normalization)方法。本仓库对三种染色归一化方式进行了封装,针对常见的病理图片处理流程实现了染色归一化工具。原创 2024-01-06 17:51:10 · 3962 阅读 · 8 评论 -
【ANTs】医学影像处理工具ANTs安装教程 - 快速安装,即插即用,无需编译
在这篇博客介绍了ANTs的一种简单的安装教程,它基于官方的Releases,只需要几步便可以完成。原创 2023-02-07 17:23:40 · 6958 阅读 · 3 评论