「毅硕|生信教程」 micromamba：mamba的C++实现，超越conda

1 Micromamba 简介

大家是否有这样的经历，使用conda/anaconda进行环境配置的是否速度非常慢，进度经常卡在“Collecting package metadata”上。甚至有时候需要安装的软件比较多，或者需要用到conda-forge这个最大的channel，conda能一直卡在collecting步骤上直到http连接超时也没能处理完毕。直到有天小编发现了mamba这个工具，进而发现了micromamba（micromamba是mamba包管理器的小型版本，采用C++实现，具有mamba的核心功能，且体积更小，可以脱离conda独立运行，更易于部署），从此再也没有因为生信软件的安装配置而烦恼抓狂过。闲话少说，开始我们的教程。

2 Micromamba 教程

  2.1 安装与配置

小编比较推荐国内用户从miniconda的安装起手，这里使用的是TUNA镜像站的链接，https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py311_24.4.0-0-Linux-x86_64.sh。下载完毕后，执行命令

sh Miniconda3-py311_24.4.0-0-Linux-x86_64.sh

通常没有特殊需求的情况下，一路“enter，yes”把miniconda安装到${HOME}/miniconda3即可。一般安装完毕后会询问是否直接执行conda init命令，回车即可。这样以后登录的时候就自动加载进入base环境，可以便捷使用conda的各种功能。如果没有继续回车执行，或者执行失败，则可以

${HOME}/miniconda3/bin/conda in