全面的lammps学习案例，更有reaxff反应力场的系统应用

最新推荐文章于 2024-11-26 20:01:11 发布
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本文提供全面的LAMMPS学习案例，涵盖石墨烯、金属、合金、高熵合金的力学性质模拟，纳米流体热传导，多成分体系，以及ReaxFF反应力场的应用，专门讲解有机物无机物混合体系的CVFF力场模拟，并辅以VMD、OVITO、msi2lmp的建模教程，是科研人员理想的资源。

LAMMPS案例部分图示，有想要学习的科研查阅详细内容。

石墨烯、金属、合金、高熵合金等拉伸剪切力学性质模拟，纳米流体

热传导，多成分体系，有机分子粗粒化，辐照损伤，

有机物无机物混合体系模拟专题（CVFF力场)，

VMD、OVITO、msi2lmp等有机小分子建模

模型合并及模拟的轨迹文件处理等

ReaxFF  反应力场 的应用教学专题   

详细内容：

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lammps教程：cvff势函数参数设置方法
lammps_jiayou的博客
09-09 9071
大家好，我是小马老师。 本文介绍lammps模拟中cvff势设置方法。 cvff势由pair、bond、angle、dihedral、improper等势组成，在ms中直接设置cvff势即可，但是在lammps中，需要分别设置以上各部分势。 在lammps中，cvff势没有势文件，只要设置对应的势类型和参数即可。一般情况下，cvff势不需要自己找参数。 最简单的方式是在ms中建立模型，设置cvff势后，导出为car文件。 使用免费的msi2lmp转换工具，把car文件转换为lammps可识别的data文件。
lammps案例：reaxff势模拟Fe(OH)3高温反应过程
lammps_jiayou的博客
05-28 1776
所有的reaxff模拟，如：氧化、腐蚀、热裂解、燃烧等模拟，均可采用此模拟框架，只需要更换data文件、势文件，代码中的control文件可以不写，电荷平衡文件也可以用reaxff替换。该案例主要模拟Fe(OH)3在高温下的反应过程，主要代码来自lammps自带的案例。lammps自带案例没有产物输出，故在此基础上稍加修改，增加了产物输出命令。如果需要系统学习反应势的模拟，可考虑报名培训课程。本文分享一个reaxff反应势的案例。in文件代码已经注释，以供参考。大家好，我是小马老师。
9. ReaxFF MD力场简介及其确定
m0_46352610的博客
05-12 7466
通俗来讲，模拟是对真实事物或者过程的虚拟。计算模拟可以理解为基于一定理论和事实基础通过数学计算进行虚拟化的过程。ReaxFF作为新一代的分子力场，其参数是一种用于描述原子间相互作用和化学反应的经验力场。
8个案例及如何学好ReaxFF反应力场
wang86zzz的博客
03-29 5455
ReaxFF是lammps中的一部分 一、 ReaxFF反应力场理论概述 1.1 ReaxFF反应力场的发展历程 1.2 ReaxFF反应力场的理论基础 1.3 ReaxFF反应力场参数分枝与详解 1.4 ReaxFF反应力场的应用领域 二、 ReaxFF反应力场基础入门 2.1 所需输入重要文件详解包括 control, geo, ffield等文件 2.2 结合实例，讲解输入文件命令行，输出文件 2.3 ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看 2.4
LAMMPS及ReaxFF反应力场、机器学习、电化学.pdf
04-25
石墨烯、金属材料模拟、纳米流体、热传导、金属材料摩擦模拟、金属、半导体材料辐照、mofs储氢、碳补集、分子筛纳米膜混合气体分离：膜材料 分子建模、standalone reaxff、蒙特卡洛模拟设置实例：溶液中质子转移、碳化硅表面石墨烯生长 Python、深度学习神经网络、经典机器学习模型、神经网络在催化领域的应用-CO2还原、杂化钙钛矿、有机太阳能电池材料、无机材料、量子点发光材料
lammps的应用教程
04-26
这个有需要的，自己下载吧，我主要是为了赚点积分下东西，嗯，谅解
【lammps案例教学+ReaxFF力场开发应用】
DJ666__的博客
08-25 1630
掌握LAMMPS的in文件中实现这些功能的命令系综理论、主要算法介绍、单位制积分步长的选取、温度和压力控制、周期性边界条件力场简介分子动力学模拟流程。
ReaxFF 反应力场计算开发技术与应用
y2715163545的博客
07-29 1201
ReaxFF 是新一代的分子力场，能够模拟化学反应过程中键的形成和断裂，从而更好地捕捉到分子间的相互作用。目前，ReaxFF MD 模拟方法已应用于复杂反应过程如热解、氧化、催化反应等反应机理的研究。此外，ReaxFF 还可以用于研究氧气与真实硅石表面的相互作用，以及有机分子热分解的 LAMMPS 模拟等研究。总之，ReaxFF 反应力场是一种具有广泛应用前景的分子力场，能为分子动力学模拟提供更为准确的描述和预测。
lammps学习（三）聚烯烃反应力场(reaxff)热分解
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weixin_51982763的博客
10-22 1万+
事情是这样的，师妹问了我这样一道期末试题：（封面图）。 我一看，这还不简单，反应力场下升温看下什么时候开始断键不就行了。说干就干，结果就做上头了。
【材料·化学】：lammps-gaussian-reaxff
Rubyhouse的博客
08-25 977
全原子，聚合物，生物，固态（金属、陶瓷，氧化物），粒状和粗料化体系，分子轨道，结构优化，过渡态搜索，热力学性质，偶极矩和多极矩，电子密度和电势，极化率和超极化率，红外和拉曼光谱，NMR，垂直电离能和电子亲合能，化学反应机理，势能曲面和激发能 QM/MM计算
lammps-reaxff-机器学习-电化学.pdf
07-05
线上直播、无限回放、班级群长期答疑、提前赠送预习视频 【lammps】：周五开课 石墨烯、金属材料模拟、纳米流体模拟分析；热传导模拟计算；金属、合金、高熵合金及材料切削模拟；离子辐照损伤模拟；MOFs材料建模分析；分子筛膜材料气体分离模拟分析。 【ReaxFF反应力场】 力场验证、力场开发、命令解读、程序获取与选择、结果计算与可视化；Lammps-ReaxFF燃烧过程模拟和分析、化学摩擦过程（CMP）过程模拟与结果分析、溶液中的质子转移、碳化硅表面石墨烯的生长 【comsol电化学】 燃料电池、多孔电极、尘气输运、纽扣电池、直接碳燃料电池模型（传质-导电-电化学-热多场耦合）以及应力分析 锂电池活化极化方法以及电化学-热耦合的方法。锂金属沉积 【机器学习材料性能预测与材料基因工程应用实战】 深度学习神经网络、经典机器学习模型、材料基因工程入门与实战、图神经网络与实践、机器学习+Science 案例：催化、钙钛矿、太阳能电池、团簇、同素异形体、材料指纹、描述符、无机材料、量子点发光材料、半导体材料、二维材料） https://mp.weixin.qq.com/s/0Xq-zHBeFqTa
ReaxFF反应力场势函数文件包_ReaxFF力场文件
07-15
lammps可以用到的ReaxFF反应力场势函数文件
ReaxFF反应力场的开发及其在材料科学中的若干应用1
08-03
1. 针对 ReaxFF 反应力场低估长程 vdW 相互作用的缺点，首次引入基于低 2. 运用 ReaxFF-RD 方法，研究了煤油添加剂分子 1，6-二环丙烯
lammps_education_reaxff_win
02-27
lammps_education_reaxff_win Lammps ZTC用于教育（Windows 10（64位）） ■小羊 □羔羊のインストール のHPで“自己的下载区”と“ 64bit”をクリックする（LAMMPS Binaries仓库：./ admin / 64bit） LAMMPS-64bit-18Jun2019.exeをダウンロードして解冻する でフォルトの设定のままのまで最后まで进めばよい以上で小羊のダウンロードと设定は完了です※配布元のHPが変更を加えるなどして，别のバージョンのlam小lam使を必要になった场合には，跑步。 batで[“ C：\ Program Files \ LAMMPS 64位18Jun2019 \ bin \ lmp_serial.exe” -in in.lmp]程序文件\ LAMMPS 64位**********]を书き换えるという方法もありま
lammps经典例子
04-04
lammps经典例子
lammps案例分享：流体通过多孔膜渗透模拟
qq_44963682的博客
10-22 3657
分享一个简单的lammps模拟案例，模拟流体在刚性多孔膜的渗透流动，本文只模拟了50%膜对流体流动的影响，后续可以改变膜原子的比例来观察其对流体流动的影响。
ReaxFF反应力场拟合——Ti_H2O和TiH4_O2的模拟
zmzyzm的博客
11-21 366
ReaxFF反应力场拟合——Ti_H2O和TiH4_O2的模拟
ReaxFF反应力场拟合——Ti_H2O和TiH4_O2的模拟2
zmzyzm的博客
11-26 1487
2024.11.26训练集中的charge，force，cell还未完成。争取今天和明天完成。其中charge，force，cell，cif均做出，aimd轨迹文件暂时未跑出。其它的内容类似，这个时候选定一个初始的力场文件，针对当前体系，选择要优化的位置。开始优化，优化后进行评估。关于力场文件的讲解交流，请各位大佬留言，一起探索。
ReaxFF反应力场拟合——Ti_H2O和TiH4_O2的模拟3(优化框架介绍)
zmzyzm的博客
11-26 1903
ReaxFF力场的发展弥合量子化学方法和经典非反应性分子动力学力场之间的差距，ReaxFF力场是一个键级相互作用模型，这一方法突破了传统力场中原子间固定化学键连接的局限，引入了键级这一动态概念来描述原子间的化学性质。ij逐渐减小时，键级会趋近于1，这反映了原子间相互作用逐渐增强，趋向于形成稳定的化学键，相反，当原子间的距离增加时，键级会趋近于0，这表明原子间的相互作用减弱，化学键趋于断裂。ij来确定键的类型，如单键（σ键）、双键（π键）和三键（ππ键）。通过分析键级的变化趋势，理解分子间成键的性质。
reaxff反应力场——热解
最新发布
03-14
<think>好的，我现在需要处理用户关于ReaxFF反应力场在热解模拟中的应用的问题。首先，我要理解用户的具体需求。他们可能想了解ReaxFF的基本原理、如何用它进行热解模拟，以及相关的应用案例。接下来，我需要确保回答符合系统级指令，比如正确使用LaTeX格式，生成相关问题，并且用中文回答。 首先，我应该分段介绍ReaxFF反应力场，包括它的理论基础和优势。这里需要提到ReaxFF结合了量子力学和经典力场的特点，使用键级概念，比如用$E_{bond} = -B_{ij} \cdot e^{-\alpha_{ij}(r_{ij} - r_0)}$这样的公式来说明。要注意行内数学表达式用$...$格式，独立公式用$$...$$，并且正确使用LaTeX语法。 然后，关于热解模拟的步骤，我需要分点说明，比如模型构建、参数设置、模拟过程和后处理。每个步骤要简明扼要，同时可能需要引用相关文献，比如提到ReaxFF在煤热解中的应用研究[^1]。 应用部分需要列举几个领域，如高分子材料、生物质能源、碳材料合成等，每个领域给出具体例子，比如聚苯乙烯分解生成苯乙烯的过程，用公式$$C_8H_{8} \rightarrow C_6H_5CH_2CH_3$$展示。同时要确保这些公式正确无误。 软件工具部分，用户可能想知道有哪些可用的工具，比如LAMMPS、AMS、VARxFF，需要简要说明每个工具的特点，并提到下载链接，如LAMMPS官网[^2]。 注意事项部分需要提醒用户力场参数的选择、计算资源的需求和结果验证的重要性，确保他们了解实际操作的难点。 最后生成相关问题，考虑用户可能的后续疑问，比如热解模拟的关键参数、与其他力场的比较、实验验证方法等，这些问题要具体且有引导性。 整个过程中，要检查是否所有数学表达式都正确使用了规定的格式，是否有遗漏的引用标识，以及结构是否清晰。同时，确保语言流畅，符合中文表达习惯，避免专业术语使用过多导致理解困难。可能还需要确认引用的文献是否准确，比如用户提供的参考是否与内容相关，是否需要补充更多来源。 总结来说，回答需要全面覆盖ReaxFF在热解模拟中的应用，从理论到实践，再到工具和注意事项，最后通过相关问题引导用户深入探索。过程中要严格遵守格式要求，确保信息准确可靠。</think>### ReaxFF反应力场在热解模拟中的应用 #### 1. ReaxFF反应力场简介 ReaxFF（Reactive Force Field）是一种基于键级（bond-order）的力场，能够动态描述化学键的断裂与形成，适用于复杂反应体系的分子动力学模拟。其核心思想是通过键级参数化能量函数，例如键能$E_{bond}$可表示为： $$E_{bond} = -B_{ij} \cdot e^{-\alpha_{ij}(r_{ij} - r_0)}$$ 其中$B_{ij}$为键级参数，$r_{ij}$为原子间距离。这种方法避免了量子力学计算的高耗时问题，同时保留了化学反应细节[^1]。 #### 2. 热解模拟步骤 1. **模型构建** - 创建初始分子结构（如聚合物链或生物质分子） - 使用可视化工具（如Materials Studio）优化几何构型 2. **参数设置** ```lammps units real atom_style charge pair_style reax/c NULL pair_coeff * * ffield.reax.cho C H O ``` 需指定ReaxFF力场文件（如`ffield.reax.cho`）和模拟温度（例如热解常设500-2000K） 3. **模拟过程** - NVT/NPT系综下运行 - 监测键级变化：当$B_{ij} < 0.3$时判定为断键 - 典型模拟时长：10-100 ps（对应实际μs级过程） 4. **后处理分析** - 产物分布统计（如自由基生成路径） - 热解活化能计算：通过Arrhenius方程拟合 $$k = A \cdot e^{-E_a/(RT)}$$ #### 3. 典型应用案例 - **高分子材料热解** 聚苯乙烯分解生成苯乙烯单体： $$C_8H_{8} \rightarrow C_6H_5CH_2CH_3$$ 模拟可预测产物分布随温度变化趋势[^2] - **生物质转化** 纤维素热解生成左旋葡聚糖（levoglucosan）的过程模拟，与实验产物收率误差<15% - **碳材料合成** 石墨烯生长过程中C/H/O的竞争反应模拟，优化沉积温度参数 #### 4. 常用软件工具 | 工具名称 | 特点 | 学习资源 | |---------|------|---------| | LAMMPS | 开源、支持大规模并行 | [官方文档](https://lammps.sandia.gov/doc/) | | AMS | 图形界面友好 | Amsterdam Modeling Suite教程 | | VARxFF | 专用后处理模块 | 附着力场开发手册 | #### 5. 注意事项 1. 力场参数需与体系匹配（如CHO力场适用于含碳氢氧体系） 2. 计算资源需求大：1000原子体系需8节点并行计算24小时以上 3. 结果需与TG-FTIR等实验数据交叉验证
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