16、潜在树模型森林在基因关联研究中的应用及激光多普勒血流仪原型验证

潜在树模型森林在基因关联研究中的应用及激光多普勒血流仪原型验证

潜在树模型森林在基因关联研究中的应用

在基因关联研究中，检测间接遗传关联是一个重要的研究方向。通过对模拟数据和真实数据的分析，发现潜在树模型森林（FLTM）在这方面具有显著的优势。

模拟数据验证

在3600次运行（36种场景×100次重复）中，最多生成了7层。但第三层及以上的结果未被报告，因为这些层的数据不足以计算有代表性的中位数或绘制有意义的箱线图。在所有3600个FLTM中，节点的百分比分布如下：
| 层 | 节点百分比 |
| ---- | ---- |
| 0层 | 89.1% |
| 1层 | 9.5% |
| 2层 | 1.2% |
| 3层 | 0.2% |

为了评估关联的显著性，考虑的是 -log₁₀(p值)。接近0的值表示独立性，该指标随依赖性的增强而增加。通过比较Y与A节点和O节点的关联测试得到的 -log₁₀(p值)直方图，发现两者分布存在很大差异。A节点中70%的 -log₁₀(p值)大于1，而O节点中只有19%。大的 -log₁₀(p值)（如大于5）在A节点中很常见，在O节点中则非常罕见。非参数检验（Wilcoxon秩和检验）显示p值小于10⁻¹⁶，证实了A和O的p值遵循不同的分布。

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