医疗影像与人工智能
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飞行codes
资浅程序员，博士
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ECG心电数据文件.xml读取
xml设计用来传输和存储数据树形结构 由标签对组成，<aa></aa> 标签可以有属性：<aa id='string'></aa> 标签对可以嵌入数据：<aa>data</aa> 标签可以嵌入子标签（具有层级关系）（未完待续）...原创 2020-07-14 18:29:45 · 3341 阅读 · 1 评论 -
nii文件转mha, numpy转mha,dicom转mha
首先安装conda install -c simpleitk simpleitk未完待续原创 2020-07-07 18:13:44 · 1778 阅读 · 5 评论 -
三维医疗影像打开和保存.vtk文件的python代码
视觉效果科学原创 2020-07-03 09:50:11 · 1589 阅读 · 1 评论 -
淋巴结病理数字玻片读取与处理代码
Whole-slide images are generally stored in a multi-resolution pyramid structure.首先安装openslide模块pip install openslide-pythonimport os.path as ospimport openslidefrom pathlib import Path...原创 2020-01-19 11:39:59 · 1099 阅读 · 0 评论 -
图像语义分割常用GAP代码实现（global average pooling）
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医疗图像csv文件处理代码python
利用pandasimport pandasimport numpy as npLUNA_LABEL = '/.csv'a=pandas.read_csv(LUNA_LABEL)annos = np.array(pandas.read_csv(LUNA_LABEL))files=annos[:,0]file_multi=[]for file_i in file...原创 2020-01-02 15:23:12 · 594 阅读 · 0 评论 -
深度学习的归一化和反归一化
医学影像应用场景的特点是训练数据少，数据分布高度不均匀，数据标注的一致性较差，数据类型丰富（多模态，文本+影像等）。1 除最大值法def read_and_normalize_train_data(): train_data, train_label = load_train() print('Convert to numpy...') train_data ...原创 2018-12-28 17:41:27 · 12120 阅读 · 1 评论 -
CT调整窗宽窗位
常见人体组织的CT值（HU） 组织 CT值 组织 CT值骨组织 ＞400 肝脏 50～70 钙值 80～300 脾脏 35～60 血块 64～84 胰腺 30～55 脑白质 25～34...原创 2019-04-22 15:35:07 · 4640 阅读 · 7 评论